Protein–RNA interactions for Protein: O15111

CHUK, Inhibitor of nuclear factor kappa-B kinase subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHUKO15111 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHUKO15111 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CHUKO15111 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHUKO15111 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHUKO15111 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHUKO15111 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHUKO15111 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHUKO15111 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHUKO15111 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHUKO15111 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHUKO15111 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHUKO15111 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHUKO15111 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHUKO15111 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHUKO15111 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CHUKO15111 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHUKO15111 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
CHUKO15111 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHUKO15111 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHUKO15111 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHUKO15111 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHUKO15111 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHUKO15111 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHUKO15111 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHUKO15111 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHUKO15111 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHUKO15111 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHUKO15111 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHUKO15111 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHUKO15111 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHUKO15111 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CHUKO15111 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHUKO15111 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHUKO15111 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHUKO15111 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHUKO15111 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHUKO15111 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHUKO15111 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHUKO15111 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHUKO15111 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHUKO15111 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHUKO15111 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHUKO15111 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHUKO15111 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHUKO15111 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHUKO15111 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHUKO15111 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHUKO15111 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHUKO15111 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHUKO15111 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHUKO15111 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHUKO15111 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHUKO15111 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHUKO15111 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHUKO15111 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHUKO15111 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHUKO15111 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHUKO15111 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHUKO15111 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHUKO15111 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHUKO15111 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHUKO15111 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHUKO15111 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHUKO15111 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHUKO15111 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHUKO15111 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHUKO15111 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHUKO15111 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHUKO15111 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHUKO15111 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHUKO15111 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHUKO15111 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHUKO15111 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHUKO15111 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHUKO15111 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHUKO15111 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHUKO15111 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHUKO15111 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHUKO15111 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CHUKO15111 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHUKO15111 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CHUKO15111 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHUKO15111 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CHUKO15111 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CHUKO15111 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CHUKO15111 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CHUKO15111 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CHUKO15111 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CHUKO15111 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHUKO15111 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHUKO15111 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHUKO15111 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHUKO15111 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHUKO15111 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHUKO15111 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHUKO15111 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHUKO15111 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHUKO15111 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHUKO15111 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHUKO15111 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 492.9 ms