Protein–RNA interactions for Protein: O15084

ANKRD28, Serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory ankyrin repeat subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28O15084 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ANKRD28O15084 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ANKRD28O15084 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ANKRD28O15084 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ANKRD28O15084 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ANKRD28O15084 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ANKRD28O15084 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ANKRD28O15084 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ANKRD28O15084 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ANKRD28O15084 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ANKRD28O15084 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ANKRD28O15084 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ANKRD28O15084 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ANKRD28O15084 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ANKRD28O15084 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ANKRD28O15084 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
ANKRD28O15084 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ANKRD28O15084 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ANKRD28O15084 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ANKRD28O15084 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ANKRD28O15084 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ANKRD28O15084 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ANKRD28O15084 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ANKRD28O15084 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ANKRD28O15084 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ANKRD28O15084 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ANKRD28O15084 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ANKRD28O15084 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ANKRD28O15084 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ANKRD28O15084 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ANKRD28O15084 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ANKRD28O15084 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ANKRD28O15084 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ANKRD28O15084 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ANKRD28O15084 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ANKRD28O15084 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ANKRD28O15084 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ANKRD28O15084 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ANKRD28O15084 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ANKRD28O15084 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ANKRD28O15084 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ANKRD28O15084 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ANKRD28O15084 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ANKRD28O15084 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ANKRD28O15084 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ANKRD28O15084 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ANKRD28O15084 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ANKRD28O15084 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ANKRD28O15084 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ANKRD28O15084 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ANKRD28O15084 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ANKRD28O15084 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ANKRD28O15084 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ANKRD28O15084 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ANKRD28O15084 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ANKRD28O15084 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ANKRD28O15084 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ANKRD28O15084 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ANKRD28O15084 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ANKRD28O15084 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ANKRD28O15084 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ANKRD28O15084 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ANKRD28O15084 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ANKRD28O15084 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ANKRD28O15084 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ANKRD28O15084 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ANKRD28O15084 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ANKRD28O15084 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ANKRD28O15084 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ANKRD28O15084 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ANKRD28O15084 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ANKRD28O15084 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ANKRD28O15084 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ANKRD28O15084 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ANKRD28O15084 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ANKRD28O15084 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ANKRD28O15084 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ANKRD28O15084 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ANKRD28O15084 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ANKRD28O15084 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ANKRD28O15084 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ANKRD28O15084 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ANKRD28O15084 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ANKRD28O15084 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ANKRD28O15084 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ANKRD28O15084 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ANKRD28O15084 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ANKRD28O15084 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
ANKRD28O15084 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ANKRD28O15084 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ANKRD28O15084 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ANKRD28O15084 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ANKRD28O15084 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ANKRD28O15084 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ANKRD28O15084 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ANKRD28O15084 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ANKRD28O15084 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ANKRD28O15084 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ANKRD28O15084 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ANKRD28O15084 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms