Protein–RNA interactions for Protein: O15061

SYNM, Synemin, humanhuman

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNMO15061 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
SYNMO15061 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC32.92■■■□□ 2.86
SYNMO15061 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
SYNMO15061 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
SYNMO15061 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
SYNMO15061 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
SYNMO15061 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC32.91■■■□□ 2.86
SYNMO15061 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC32.91■■■□□ 2.86
SYNMO15061 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
SYNMO15061 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
SYNMO15061 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
SYNMO15061 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC32.91■■■□□ 2.86
SYNMO15061 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC32.91■■■□□ 2.86
SYNMO15061 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC32.9■■■□□ 2.86
SYNMO15061 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
SYNMO15061 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
SYNMO15061 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
SYNMO15061 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
SYNMO15061 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
SYNMO15061 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
SYNMO15061 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
SYNMO15061 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
SYNMO15061 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC32.89■■■□□ 2.86
SYNMO15061 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC32.89■■■□□ 2.86
SYNMO15061 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
SYNMO15061 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC32.88■■■□□ 2.85
SYNMO15061 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC32.88■■■□□ 2.85
SYNMO15061 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
SYNMO15061 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
SYNMO15061 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
SYNMO15061 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC32.88■■■□□ 2.85
SYNMO15061 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
SYNMO15061 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC32.87■■■□□ 2.85
SYNMO15061 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
SYNMO15061 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
SYNMO15061 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
SYNMO15061 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
SYNMO15061 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC32.87■■■□□ 2.85
SYNMO15061 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
SYNMO15061 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC32.87■■■□□ 2.85
SYNMO15061 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
SYNMO15061 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
SYNMO15061 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
SYNMO15061 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
SYNMO15061 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
SYNMO15061 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
SYNMO15061 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC32.86■■■□□ 2.85
SYNMO15061 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC32.86■■■□□ 2.85
SYNMO15061 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
SYNMO15061 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
SYNMO15061 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
SYNMO15061 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
SYNMO15061 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC32.85■■■□□ 2.85
SYNMO15061 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
SYNMO15061 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
SYNMO15061 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
SYNMO15061 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
SYNMO15061 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC32.84■■■□□ 2.85
SYNMO15061 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
SYNMO15061 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
SYNMO15061 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
SYNMO15061 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC32.83■■■□□ 2.85
SYNMO15061 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC32.83■■■□□ 2.85
SYNMO15061 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC32.83■■■□□ 2.85
SYNMO15061 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC32.83■■■□□ 2.85
SYNMO15061 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
SYNMO15061 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
SYNMO15061 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
SYNMO15061 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
SYNMO15061 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
SYNMO15061 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
SYNMO15061 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
SYNMO15061 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
SYNMO15061 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC32.83■■■□□ 2.85
SYNMO15061 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
SYNMO15061 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
SYNMO15061 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
SYNMO15061 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC32.83■■■□□ 2.85
SYNMO15061 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
SYNMO15061 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
SYNMO15061 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
SYNMO15061 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
SYNMO15061 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
SYNMO15061 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
SYNMO15061 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
SYNMO15061 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
SYNMO15061 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC32.81■■■□□ 2.84
SYNMO15061 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
SYNMO15061 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
SYNMO15061 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
SYNMO15061 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
SYNMO15061 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
SYNMO15061 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
SYNMO15061 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
SYNMO15061 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
SYNMO15061 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
SYNMO15061 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
SYNMO15061 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
SYNMO15061 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC32.8■■■□□ 2.84
SYNMO15061 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms