Protein–RNA interactions for Protein: O14904

WNT9A, Protein Wnt-9a, humanhuman

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WNT9AO14904 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
WNT9AO14904 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
WNT9AO14904 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
WNT9AO14904 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
WNT9AO14904 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
WNT9AO14904 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
WNT9AO14904 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
WNT9AO14904 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
WNT9AO14904 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
WNT9AO14904 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
WNT9AO14904 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
WNT9AO14904 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
WNT9AO14904 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
WNT9AO14904 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
WNT9AO14904 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
WNT9AO14904 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
WNT9AO14904 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
WNT9AO14904 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
WNT9AO14904 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
WNT9AO14904 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
WNT9AO14904 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
WNT9AO14904 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
WNT9AO14904 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
WNT9AO14904 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
WNT9AO14904 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
WNT9AO14904 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
WNT9AO14904 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
WNT9AO14904 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
WNT9AO14904 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
WNT9AO14904 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
WNT9AO14904 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
WNT9AO14904 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
WNT9AO14904 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
WNT9AO14904 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
WNT9AO14904 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
WNT9AO14904 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
WNT9AO14904 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
WNT9AO14904 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
WNT9AO14904 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
WNT9AO14904 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
WNT9AO14904 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
WNT9AO14904 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
WNT9AO14904 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
WNT9AO14904 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
WNT9AO14904 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
WNT9AO14904 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
WNT9AO14904 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
WNT9AO14904 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
WNT9AO14904 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
WNT9AO14904 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
WNT9AO14904 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
WNT9AO14904 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
WNT9AO14904 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
WNT9AO14904 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
WNT9AO14904 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
WNT9AO14904 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
WNT9AO14904 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
WNT9AO14904 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
WNT9AO14904 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
WNT9AO14904 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
WNT9AO14904 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
WNT9AO14904 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
WNT9AO14904 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
WNT9AO14904 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
WNT9AO14904 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
WNT9AO14904 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
WNT9AO14904 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
WNT9AO14904 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
WNT9AO14904 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
WNT9AO14904 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
WNT9AO14904 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
WNT9AO14904 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
WNT9AO14904 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
WNT9AO14904 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
WNT9AO14904 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
WNT9AO14904 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
WNT9AO14904 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
WNT9AO14904 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
WNT9AO14904 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
WNT9AO14904 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
WNT9AO14904 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
WNT9AO14904 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
WNT9AO14904 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
WNT9AO14904 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
WNT9AO14904 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
WNT9AO14904 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
WNT9AO14904 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
WNT9AO14904 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
WNT9AO14904 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
WNT9AO14904 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
WNT9AO14904 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
WNT9AO14904 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
WNT9AO14904 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
WNT9AO14904 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
WNT9AO14904 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
WNT9AO14904 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
WNT9AO14904 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
WNT9AO14904 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
WNT9AO14904 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
WNT9AO14904 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms