Protein–RNA interactions for Protein: O14813

PHOX2A, Paired mesoderm homeobox protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHOX2AO14813 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PHOX2AO14813 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PHOX2AO14813 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PHOX2AO14813 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PHOX2AO14813 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PHOX2AO14813 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PHOX2AO14813 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PHOX2AO14813 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PHOX2AO14813 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PHOX2AO14813 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PHOX2AO14813 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PHOX2AO14813 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PHOX2AO14813 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PHOX2AO14813 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PHOX2AO14813 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PHOX2AO14813 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PHOX2AO14813 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PHOX2AO14813 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PHOX2AO14813 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PHOX2AO14813 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PHOX2AO14813 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PHOX2AO14813 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PHOX2AO14813 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PHOX2AO14813 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PHOX2AO14813 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PHOX2AO14813 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PHOX2AO14813 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PHOX2AO14813 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PHOX2AO14813 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PHOX2AO14813 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PHOX2AO14813 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PHOX2AO14813 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PHOX2AO14813 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PHOX2AO14813 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PHOX2AO14813 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PHOX2AO14813 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PHOX2AO14813 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PHOX2AO14813 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PHOX2AO14813 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PHOX2AO14813 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PHOX2AO14813 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PHOX2AO14813 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PHOX2AO14813 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PHOX2AO14813 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PHOX2AO14813 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PHOX2AO14813 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PHOX2AO14813 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PHOX2AO14813 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PHOX2AO14813 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PHOX2AO14813 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PHOX2AO14813 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PHOX2AO14813 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PHOX2AO14813 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PHOX2AO14813 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
PHOX2AO14813 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PHOX2AO14813 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PHOX2AO14813 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PHOX2AO14813 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PHOX2AO14813 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PHOX2AO14813 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PHOX2AO14813 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PHOX2AO14813 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PHOX2AO14813 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PHOX2AO14813 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PHOX2AO14813 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PHOX2AO14813 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PHOX2AO14813 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PHOX2AO14813 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PHOX2AO14813 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PHOX2AO14813 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PHOX2AO14813 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PHOX2AO14813 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
PHOX2AO14813 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
PHOX2AO14813 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PHOX2AO14813 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PHOX2AO14813 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PHOX2AO14813 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PHOX2AO14813 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
PHOX2AO14813 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PHOX2AO14813 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PHOX2AO14813 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PHOX2AO14813 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PHOX2AO14813 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PHOX2AO14813 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PHOX2AO14813 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PHOX2AO14813 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PHOX2AO14813 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PHOX2AO14813 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PHOX2AO14813 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PHOX2AO14813 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PHOX2AO14813 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PHOX2AO14813 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PHOX2AO14813 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PHOX2AO14813 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PHOX2AO14813 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
PHOX2AO14813 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PHOX2AO14813 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PHOX2AO14813 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PHOX2AO14813 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PHOX2AO14813 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms