Protein–RNA interactions for Protein: O14598

VCY, Testis-specific basic protein Y 1, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCYO14598 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VCYO14598 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VCYO14598 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VCYO14598 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VCYO14598 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VCYO14598 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VCYO14598 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VCYO14598 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VCYO14598 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VCYO14598 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VCYO14598 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VCYO14598 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VCYO14598 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VCYO14598 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VCYO14598 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VCYO14598 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VCYO14598 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VCYO14598 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VCYO14598 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VCYO14598 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VCYO14598 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VCYO14598 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VCYO14598 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VCYO14598 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VCYO14598 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VCYO14598 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VCYO14598 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VCYO14598 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VCYO14598 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VCYO14598 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VCYO14598 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VCYO14598 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VCYO14598 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VCYO14598 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VCYO14598 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VCYO14598 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VCYO14598 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VCYO14598 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VCYO14598 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VCYO14598 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VCYO14598 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VCYO14598 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VCYO14598 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VCYO14598 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VCYO14598 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VCYO14598 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VCYO14598 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VCYO14598 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VCYO14598 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VCYO14598 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VCYO14598 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VCYO14598 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VCYO14598 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VCYO14598 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VCYO14598 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VCYO14598 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VCYO14598 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VCYO14598 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VCYO14598 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VCYO14598 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VCYO14598 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VCYO14598 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VCYO14598 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VCYO14598 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VCYO14598 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VCYO14598 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VCYO14598 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VCYO14598 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VCYO14598 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VCYO14598 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VCYO14598 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VCYO14598 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
VCYO14598 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VCYO14598 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VCYO14598 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VCYO14598 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
VCYO14598 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VCYO14598 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VCYO14598 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VCYO14598 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VCYO14598 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VCYO14598 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VCYO14598 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VCYO14598 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VCYO14598 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VCYO14598 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VCYO14598 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VCYO14598 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VCYO14598 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VCYO14598 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VCYO14598 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VCYO14598 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VCYO14598 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VCYO14598 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VCYO14598 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VCYO14598 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VCYO14598 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VCYO14598 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VCYO14598 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VCYO14598 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms