Protein–RNA interactions for Protein: O14530

TXNDC9, Thioredoxin domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNDC9O14530 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TXNDC9O14530 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TXNDC9O14530 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TXNDC9O14530 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TXNDC9O14530 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TXNDC9O14530 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TXNDC9O14530 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TXNDC9O14530 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TXNDC9O14530 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TXNDC9O14530 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TXNDC9O14530 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TXNDC9O14530 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TXNDC9O14530 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TXNDC9O14530 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TXNDC9O14530 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TXNDC9O14530 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TXNDC9O14530 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TXNDC9O14530 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TXNDC9O14530 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TXNDC9O14530 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TXNDC9O14530 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TXNDC9O14530 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TXNDC9O14530 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TXNDC9O14530 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TXNDC9O14530 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TXNDC9O14530 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TXNDC9O14530 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TXNDC9O14530 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TXNDC9O14530 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TXNDC9O14530 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TXNDC9O14530 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TXNDC9O14530 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TXNDC9O14530 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TXNDC9O14530 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TXNDC9O14530 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TXNDC9O14530 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TXNDC9O14530 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TXNDC9O14530 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TXNDC9O14530 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TXNDC9O14530 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TXNDC9O14530 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TXNDC9O14530 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TXNDC9O14530 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TXNDC9O14530 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TXNDC9O14530 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TXNDC9O14530 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TXNDC9O14530 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TXNDC9O14530 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TXNDC9O14530 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TXNDC9O14530 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TXNDC9O14530 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TXNDC9O14530 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TXNDC9O14530 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TXNDC9O14530 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TXNDC9O14530 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TXNDC9O14530 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TXNDC9O14530 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TXNDC9O14530 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TXNDC9O14530 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TXNDC9O14530 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TXNDC9O14530 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TXNDC9O14530 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TXNDC9O14530 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TXNDC9O14530 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TXNDC9O14530 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TXNDC9O14530 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TXNDC9O14530 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TXNDC9O14530 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TXNDC9O14530 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TXNDC9O14530 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TXNDC9O14530 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TXNDC9O14530 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TXNDC9O14530 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TXNDC9O14530 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TXNDC9O14530 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TXNDC9O14530 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TXNDC9O14530 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TXNDC9O14530 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TXNDC9O14530 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TXNDC9O14530 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TXNDC9O14530 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TXNDC9O14530 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TXNDC9O14530 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TXNDC9O14530 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TXNDC9O14530 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TXNDC9O14530 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TXNDC9O14530 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TXNDC9O14530 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TXNDC9O14530 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TXNDC9O14530 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TXNDC9O14530 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TXNDC9O14530 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TXNDC9O14530 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TXNDC9O14530 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TXNDC9O14530 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TXNDC9O14530 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TXNDC9O14530 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TXNDC9O14530 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TXNDC9O14530 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TXNDC9O14530 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms