Protein–RNA interactions for Protein: O00628

PEX7, Peroxisomal targeting signal 2 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX7O00628 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PEX7O00628 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PEX7O00628 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PEX7O00628 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PEX7O00628 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PEX7O00628 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PEX7O00628 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PEX7O00628 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PEX7O00628 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PEX7O00628 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PEX7O00628 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PEX7O00628 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PEX7O00628 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PEX7O00628 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PEX7O00628 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PEX7O00628 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PEX7O00628 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PEX7O00628 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PEX7O00628 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PEX7O00628 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PEX7O00628 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PEX7O00628 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PEX7O00628 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PEX7O00628 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PEX7O00628 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PEX7O00628 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PEX7O00628 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PEX7O00628 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PEX7O00628 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PEX7O00628 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PEX7O00628 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PEX7O00628 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PEX7O00628 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PEX7O00628 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PEX7O00628 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PEX7O00628 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PEX7O00628 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PEX7O00628 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PEX7O00628 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PEX7O00628 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PEX7O00628 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PEX7O00628 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PEX7O00628 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PEX7O00628 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PEX7O00628 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PEX7O00628 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PEX7O00628 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PEX7O00628 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PEX7O00628 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PEX7O00628 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PEX7O00628 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PEX7O00628 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PEX7O00628 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PEX7O00628 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PEX7O00628 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PEX7O00628 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PEX7O00628 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PEX7O00628 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PEX7O00628 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PEX7O00628 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PEX7O00628 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PEX7O00628 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PEX7O00628 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PEX7O00628 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PEX7O00628 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PEX7O00628 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PEX7O00628 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PEX7O00628 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PEX7O00628 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PEX7O00628 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PEX7O00628 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PEX7O00628 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PEX7O00628 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PEX7O00628 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PEX7O00628 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PEX7O00628 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PEX7O00628 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PEX7O00628 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PEX7O00628 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PEX7O00628 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PEX7O00628 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PEX7O00628 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PEX7O00628 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PEX7O00628 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PEX7O00628 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PEX7O00628 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PEX7O00628 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PEX7O00628 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PEX7O00628 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PEX7O00628 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PEX7O00628 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PEX7O00628 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PEX7O00628 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PEX7O00628 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PEX7O00628 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PEX7O00628 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
PEX7O00628 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PEX7O00628 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PEX7O00628 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PEX7O00628 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms