Protein–RNA interactions for Protein: O00548

DLL1, Delta-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 723 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DLL1O00548 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
DLL1O00548 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DLL1O00548 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DLL1O00548 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DLL1O00548 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
DLL1O00548 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DLL1O00548 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DLL1O00548 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DLL1O00548 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DLL1O00548 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DLL1O00548 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DLL1O00548 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DLL1O00548 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DLL1O00548 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DLL1O00548 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
DLL1O00548 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DLL1O00548 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DLL1O00548 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DLL1O00548 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
DLL1O00548 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
DLL1O00548 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
DLL1O00548 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
DLL1O00548 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DLL1O00548 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
DLL1O00548 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
DLL1O00548 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DLL1O00548 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
DLL1O00548 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
DLL1O00548 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DLL1O00548 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
DLL1O00548 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DLL1O00548 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DLL1O00548 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DLL1O00548 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DLL1O00548 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DLL1O00548 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DLL1O00548 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
DLL1O00548 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DLL1O00548 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DLL1O00548 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
DLL1O00548 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DLL1O00548 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DLL1O00548 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DLL1O00548 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DLL1O00548 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DLL1O00548 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DLL1O00548 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DLL1O00548 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DLL1O00548 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DLL1O00548 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
DLL1O00548 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DLL1O00548 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DLL1O00548 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DLL1O00548 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DLL1O00548 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DLL1O00548 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DLL1O00548 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DLL1O00548 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DLL1O00548 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DLL1O00548 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DLL1O00548 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DLL1O00548 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DLL1O00548 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DLL1O00548 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DLL1O00548 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DLL1O00548 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DLL1O00548 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DLL1O00548 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DLL1O00548 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DLL1O00548 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
DLL1O00548 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DLL1O00548 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DLL1O00548 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DLL1O00548 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
DLL1O00548 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
DLL1O00548 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DLL1O00548 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DLL1O00548 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DLL1O00548 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DLL1O00548 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DLL1O00548 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DLL1O00548 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DLL1O00548 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DLL1O00548 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DLL1O00548 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DLL1O00548 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
DLL1O00548 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DLL1O00548 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DLL1O00548 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
DLL1O00548 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
DLL1O00548 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
DLL1O00548 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
DLL1O00548 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
DLL1O00548 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
DLL1O00548 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
DLL1O00548 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
DLL1O00548 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
DLL1O00548 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DLL1O00548 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DLL1O00548 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms