Protein–RNA interactions for Protein: O00470

MEIS1, Homeobox protein Meis1, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS1O00470 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
MEIS1O00470 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
MEIS1O00470 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MEIS1O00470 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MEIS1O00470 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MEIS1O00470 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MEIS1O00470 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MEIS1O00470 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MEIS1O00470 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MEIS1O00470 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MEIS1O00470 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MEIS1O00470 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MEIS1O00470 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MEIS1O00470 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MEIS1O00470 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
MEIS1O00470 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MEIS1O00470 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MEIS1O00470 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MEIS1O00470 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
MEIS1O00470 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
MEIS1O00470 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MEIS1O00470 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MEIS1O00470 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MEIS1O00470 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MEIS1O00470 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MEIS1O00470 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MEIS1O00470 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MEIS1O00470 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MEIS1O00470 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MEIS1O00470 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
MEIS1O00470 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MEIS1O00470 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MEIS1O00470 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MEIS1O00470 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
MEIS1O00470 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MEIS1O00470 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
MEIS1O00470 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MEIS1O00470 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MEIS1O00470 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MEIS1O00470 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MEIS1O00470 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MEIS1O00470 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MEIS1O00470 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MEIS1O00470 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MEIS1O00470 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MEIS1O00470 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MEIS1O00470 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MEIS1O00470 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MEIS1O00470 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
MEIS1O00470 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MEIS1O00470 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MEIS1O00470 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MEIS1O00470 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MEIS1O00470 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MEIS1O00470 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MEIS1O00470 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MEIS1O00470 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MEIS1O00470 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MEIS1O00470 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
MEIS1O00470 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MEIS1O00470 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MEIS1O00470 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MEIS1O00470 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MEIS1O00470 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MEIS1O00470 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
MEIS1O00470 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MEIS1O00470 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MEIS1O00470 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MEIS1O00470 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MEIS1O00470 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
MEIS1O00470 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MEIS1O00470 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MEIS1O00470 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MEIS1O00470 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
MEIS1O00470 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
MEIS1O00470 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MEIS1O00470 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
MEIS1O00470 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MEIS1O00470 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MEIS1O00470 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MEIS1O00470 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MEIS1O00470 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MEIS1O00470 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MEIS1O00470 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
MEIS1O00470 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MEIS1O00470 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MEIS1O00470 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MEIS1O00470 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MEIS1O00470 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MEIS1O00470 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MEIS1O00470 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MEIS1O00470 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MEIS1O00470 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MEIS1O00470 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
MEIS1O00470 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MEIS1O00470 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
MEIS1O00470 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MEIS1O00470 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MEIS1O00470 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MEIS1O00470 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms