Protein–RNA interactions for Protein: O00124

UBXN8, UBX domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN8O00124 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBXN8O00124 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBXN8O00124 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBXN8O00124 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBXN8O00124 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBXN8O00124 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBXN8O00124 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBXN8O00124 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBXN8O00124 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
UBXN8O00124 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
UBXN8O00124 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBXN8O00124 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBXN8O00124 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBXN8O00124 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBXN8O00124 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBXN8O00124 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBXN8O00124 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBXN8O00124 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBXN8O00124 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBXN8O00124 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBXN8O00124 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBXN8O00124 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBXN8O00124 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBXN8O00124 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBXN8O00124 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBXN8O00124 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBXN8O00124 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBXN8O00124 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
UBXN8O00124 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
UBXN8O00124 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
UBXN8O00124 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
UBXN8O00124 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBXN8O00124 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBXN8O00124 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBXN8O00124 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBXN8O00124 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBXN8O00124 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBXN8O00124 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBXN8O00124 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBXN8O00124 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBXN8O00124 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBXN8O00124 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBXN8O00124 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBXN8O00124 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBXN8O00124 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBXN8O00124 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBXN8O00124 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBXN8O00124 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBXN8O00124 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBXN8O00124 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBXN8O00124 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBXN8O00124 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBXN8O00124 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBXN8O00124 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
UBXN8O00124 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBXN8O00124 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBXN8O00124 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBXN8O00124 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBXN8O00124 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBXN8O00124 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBXN8O00124 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBXN8O00124 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBXN8O00124 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
UBXN8O00124 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBXN8O00124 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBXN8O00124 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBXN8O00124 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBXN8O00124 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBXN8O00124 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBXN8O00124 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBXN8O00124 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBXN8O00124 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBXN8O00124 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBXN8O00124 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBXN8O00124 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBXN8O00124 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBXN8O00124 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBXN8O00124 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBXN8O00124 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBXN8O00124 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBXN8O00124 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBXN8O00124 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBXN8O00124 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBXN8O00124 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBXN8O00124 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBXN8O00124 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBXN8O00124 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBXN8O00124 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBXN8O00124 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBXN8O00124 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBXN8O00124 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBXN8O00124 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
UBXN8O00124 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBXN8O00124 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBXN8O00124 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBXN8O00124 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBXN8O00124 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBXN8O00124 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBXN8O00124 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBXN8O00124 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms