Protein–RNA interactions for Protein: J3QT63

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QT63 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
J3QT63 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
J3QT63 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
J3QT63 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
J3QT63 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
J3QT63 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
J3QT63 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
J3QT63 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
J3QT63 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
J3QT63 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
J3QT63 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
J3QT63 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
J3QT63 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
J3QT63 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
J3QT63 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
J3QT63 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
J3QT63 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
J3QT63 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
J3QT63 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
J3QT63 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
J3QT63 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
J3QT63 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
J3QT63 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
J3QT63 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
J3QT63 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
J3QT63 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
J3QT63 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
J3QT63 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
J3QT63 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
J3QT63 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
J3QT63 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
J3QT63 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
J3QT63 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
J3QT63 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
J3QT63 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
J3QT63 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
J3QT63 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
J3QT63 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
J3QT63 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
J3QT63 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
J3QT63 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
J3QT63 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
J3QT63 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
J3QT63 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
J3QT63 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
J3QT63 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
J3QT63 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
J3QT63 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
J3QT63 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
J3QT63 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
J3QT63 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
J3QT63 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
J3QT63 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
J3QT63 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
J3QT63 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
J3QT63 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
J3QT63 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
J3QT63 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
J3QT63 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
J3QT63 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
J3QT63 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
J3QT63 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
J3QT63 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
J3QT63 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
J3QT63 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
J3QT63 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
J3QT63 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
J3QT63 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
J3QT63 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
J3QT63 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
J3QT63 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
J3QT63 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
J3QT63 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
J3QT63 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
J3QT63 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
J3QT63 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
J3QT63 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
J3QT63 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
J3QT63 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
J3QT63 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
J3QT63 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
J3QT63 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
J3QT63 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
J3QT63 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
J3QT63 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
J3QT63 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
J3QT63 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
J3QT63 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
J3QT63 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
J3QT63 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
J3QT63 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
J3QT63 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
J3QT63 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
J3QT63 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
J3QT63 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
J3QT63 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC19■□□□□ 0.63
J3QT63 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
J3QT63 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
J3QT63 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
J3QT63 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.7 ms