Protein–RNA interactions for Protein: J3KTA2

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KTA2 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
J3KTA2 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
J3KTA2 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
J3KTA2 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
J3KTA2 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
J3KTA2 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
J3KTA2 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
J3KTA2 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
J3KTA2 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
J3KTA2 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
J3KTA2 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
J3KTA2 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
J3KTA2 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
J3KTA2 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
J3KTA2 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
J3KTA2 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
J3KTA2 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
J3KTA2 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
J3KTA2 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
J3KTA2 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
J3KTA2 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
J3KTA2 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
J3KTA2 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
J3KTA2 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
J3KTA2 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
J3KTA2 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
J3KTA2 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
J3KTA2 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
J3KTA2 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
J3KTA2 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
J3KTA2 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
J3KTA2 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
J3KTA2 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
J3KTA2 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
J3KTA2 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
J3KTA2 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
J3KTA2 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
J3KTA2 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC20.73■□□□□ 0.91
J3KTA2 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
J3KTA2 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
J3KTA2 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
J3KTA2 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
J3KTA2 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
J3KTA2 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
J3KTA2 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
J3KTA2 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
J3KTA2 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
J3KTA2 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
J3KTA2 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
J3KTA2 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
J3KTA2 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
J3KTA2 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
J3KTA2 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
J3KTA2 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
J3KTA2 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
J3KTA2 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
J3KTA2 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
J3KTA2 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
J3KTA2 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
J3KTA2 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
J3KTA2 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
J3KTA2 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
J3KTA2 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
J3KTA2 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
J3KTA2 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
J3KTA2 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
J3KTA2 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
J3KTA2 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
J3KTA2 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
J3KTA2 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
J3KTA2 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
J3KTA2 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
J3KTA2 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.91
J3KTA2 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
J3KTA2 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
J3KTA2 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
J3KTA2 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
J3KTA2 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
J3KTA2 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
J3KTA2 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
J3KTA2 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
J3KTA2 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
J3KTA2 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
J3KTA2 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
J3KTA2 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
J3KTA2 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
J3KTA2 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
J3KTA2 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
J3KTA2 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
J3KTA2 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
J3KTA2 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
J3KTA2 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
J3KTA2 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
J3KTA2 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
J3KTA2 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
J3KTA2 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
J3KTA2 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
J3KTA2 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
J3KTA2 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
J3KTA2 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms