Protein–RNA interactions for Protein: H3BQV1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BQV1 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
H3BQV1 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
H3BQV1 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
H3BQV1 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
H3BQV1 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
H3BQV1 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
H3BQV1 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
H3BQV1 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
H3BQV1 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
H3BQV1 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
H3BQV1 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
H3BQV1 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
H3BQV1 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
H3BQV1 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
H3BQV1 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
H3BQV1 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
H3BQV1 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
H3BQV1 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
H3BQV1 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
H3BQV1 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
H3BQV1 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
H3BQV1 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
H3BQV1 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
H3BQV1 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
H3BQV1 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
H3BQV1 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
H3BQV1 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
H3BQV1 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
H3BQV1 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
H3BQV1 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
H3BQV1 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
H3BQV1 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
H3BQV1 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
H3BQV1 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
H3BQV1 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
H3BQV1 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
H3BQV1 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
H3BQV1 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
H3BQV1 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
H3BQV1 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
H3BQV1 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
H3BQV1 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
H3BQV1 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
H3BQV1 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
H3BQV1 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
H3BQV1 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
H3BQV1 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
H3BQV1 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
H3BQV1 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
H3BQV1 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
H3BQV1 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
H3BQV1 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
H3BQV1 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
H3BQV1 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
H3BQV1 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
H3BQV1 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
H3BQV1 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
H3BQV1 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
H3BQV1 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
H3BQV1 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
H3BQV1 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
H3BQV1 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
H3BQV1 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
H3BQV1 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
H3BQV1 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
H3BQV1 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
H3BQV1 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
H3BQV1 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
H3BQV1 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
H3BQV1 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
H3BQV1 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
H3BQV1 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
H3BQV1 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
H3BQV1 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
H3BQV1 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
H3BQV1 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
H3BQV1 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
H3BQV1 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
H3BQV1 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
H3BQV1 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
H3BQV1 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
H3BQV1 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
H3BQV1 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
H3BQV1 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
H3BQV1 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
H3BQV1 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
H3BQV1 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
H3BQV1 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
H3BQV1 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
H3BQV1 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
H3BQV1 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
H3BQV1 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
H3BQV1 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
H3BQV1 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
H3BQV1 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
H3BQV1 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
H3BQV1 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
H3BQV1 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
H3BQV1 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
H3BQV1 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms