Protein–RNA interactions for Protein: H3BP13

TRAPPC2L, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2LH3BP13 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRAPPC2LH3BP13 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRAPPC2LH3BP13 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRAPPC2LH3BP13 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRAPPC2LH3BP13 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRAPPC2LH3BP13 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRAPPC2LH3BP13 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRAPPC2LH3BP13 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRAPPC2LH3BP13 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRAPPC2LH3BP13 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRAPPC2LH3BP13 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRAPPC2LH3BP13 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRAPPC2LH3BP13 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRAPPC2LH3BP13 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRAPPC2LH3BP13 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRAPPC2LH3BP13 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRAPPC2LH3BP13 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRAPPC2LH3BP13 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRAPPC2LH3BP13 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRAPPC2LH3BP13 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRAPPC2LH3BP13 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRAPPC2LH3BP13 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRAPPC2LH3BP13 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRAPPC2LH3BP13 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRAPPC2LH3BP13 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRAPPC2LH3BP13 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRAPPC2LH3BP13 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRAPPC2LH3BP13 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRAPPC2LH3BP13 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRAPPC2LH3BP13 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRAPPC2LH3BP13 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRAPPC2LH3BP13 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRAPPC2LH3BP13 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRAPPC2LH3BP13 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRAPPC2LH3BP13 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRAPPC2LH3BP13 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRAPPC2LH3BP13 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRAPPC2LH3BP13 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRAPPC2LH3BP13 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRAPPC2LH3BP13 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRAPPC2LH3BP13 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRAPPC2LH3BP13 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRAPPC2LH3BP13 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRAPPC2LH3BP13 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
TRAPPC2LH3BP13 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
TRAPPC2LH3BP13 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.67
TRAPPC2LH3BP13 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
TRAPPC2LH3BP13 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
TRAPPC2LH3BP13 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
TRAPPC2LH3BP13 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRAPPC2LH3BP13 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRAPPC2LH3BP13 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
TRAPPC2LH3BP13 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRAPPC2LH3BP13 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRAPPC2LH3BP13 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRAPPC2LH3BP13 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRAPPC2LH3BP13 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRAPPC2LH3BP13 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRAPPC2LH3BP13 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRAPPC2LH3BP13 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
TRAPPC2LH3BP13 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRAPPC2LH3BP13 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRAPPC2LH3BP13 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRAPPC2LH3BP13 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRAPPC2LH3BP13 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
TRAPPC2LH3BP13 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRAPPC2LH3BP13 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
TRAPPC2LH3BP13 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRAPPC2LH3BP13 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRAPPC2LH3BP13 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRAPPC2LH3BP13 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRAPPC2LH3BP13 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRAPPC2LH3BP13 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRAPPC2LH3BP13 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRAPPC2LH3BP13 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRAPPC2LH3BP13 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRAPPC2LH3BP13 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRAPPC2LH3BP13 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRAPPC2LH3BP13 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRAPPC2LH3BP13 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRAPPC2LH3BP13 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRAPPC2LH3BP13 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRAPPC2LH3BP13 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRAPPC2LH3BP13 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRAPPC2LH3BP13 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRAPPC2LH3BP13 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRAPPC2LH3BP13 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRAPPC2LH3BP13 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRAPPC2LH3BP13 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
TRAPPC2LH3BP13 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRAPPC2LH3BP13 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRAPPC2LH3BP13 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRAPPC2LH3BP13 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRAPPC2LH3BP13 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRAPPC2LH3BP13 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
TRAPPC2LH3BP13 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRAPPC2LH3BP13 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRAPPC2LH3BP13 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRAPPC2LH3BP13 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRAPPC2LH3BP13 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms