Protein–RNA interactions for Protein: F8VP50

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F8VP50 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
F8VP50 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
F8VP50 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
F8VP50 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
F8VP50 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
F8VP50 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
F8VP50 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
F8VP50 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
F8VP50 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
F8VP50 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
F8VP50 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
F8VP50 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
F8VP50 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
F8VP50 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
F8VP50 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
F8VP50 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
F8VP50 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
F8VP50 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
F8VP50 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
F8VP50 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
F8VP50 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
F8VP50 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
F8VP50 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
F8VP50 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
F8VP50 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
F8VP50 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
F8VP50 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
F8VP50 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
F8VP50 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
F8VP50 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
F8VP50 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
F8VP50 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
F8VP50 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
F8VP50 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
F8VP50 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
F8VP50 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
F8VP50 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
F8VP50 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
F8VP50 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
F8VP50 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
F8VP50 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
F8VP50 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
F8VP50 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
F8VP50 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
F8VP50 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
F8VP50 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
F8VP50 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
F8VP50 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
F8VP50 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
F8VP50 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
F8VP50 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
F8VP50 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
F8VP50 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
F8VP50 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
F8VP50 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
F8VP50 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
F8VP50 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
F8VP50 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
F8VP50 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
F8VP50 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
F8VP50 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
F8VP50 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
F8VP50 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
F8VP50 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
F8VP50 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
F8VP50 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
F8VP50 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
F8VP50 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
F8VP50 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
F8VP50 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
F8VP50 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
F8VP50 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
F8VP50 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
F8VP50 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
F8VP50 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
F8VP50 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
F8VP50 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
F8VP50 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
F8VP50 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
F8VP50 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
F8VP50 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
F8VP50 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
F8VP50 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
F8VP50 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
F8VP50 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
F8VP50 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
F8VP50 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
F8VP50 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
F8VP50 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
F8VP50 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
F8VP50 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
F8VP50 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
F8VP50 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
F8VP50 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
F8VP50 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
F8VP50 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
F8VP50 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
F8VP50 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
F8VP50 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
F8VP50 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms