Protein–RNA interactions for Protein: B4DU55

ZNF879, Zinc finger protein 879, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF879B4DU55 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZNF879B4DU55 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZNF879B4DU55 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZNF879B4DU55 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZNF879B4DU55 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZNF879B4DU55 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZNF879B4DU55 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZNF879B4DU55 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ZNF879B4DU55 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ZNF879B4DU55 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ZNF879B4DU55 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ZNF879B4DU55 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ZNF879B4DU55 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ZNF879B4DU55 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ZNF879B4DU55 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ZNF879B4DU55 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ZNF879B4DU55 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ZNF879B4DU55 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ZNF879B4DU55 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ZNF879B4DU55 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ZNF879B4DU55 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ZNF879B4DU55 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ZNF879B4DU55 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ZNF879B4DU55 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ZNF879B4DU55 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ZNF879B4DU55 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ZNF879B4DU55 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ZNF879B4DU55 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ZNF879B4DU55 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ZNF879B4DU55 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ZNF879B4DU55 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ZNF879B4DU55 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ZNF879B4DU55 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
ZNF879B4DU55 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
ZNF879B4DU55 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
ZNF879B4DU55 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ZNF879B4DU55 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ZNF879B4DU55 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
ZNF879B4DU55 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ZNF879B4DU55 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
ZNF879B4DU55 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNF879B4DU55 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNF879B4DU55 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNF879B4DU55 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNF879B4DU55 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNF879B4DU55 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNF879B4DU55 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNF879B4DU55 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNF879B4DU55 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNF879B4DU55 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNF879B4DU55 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNF879B4DU55 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNF879B4DU55 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNF879B4DU55 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNF879B4DU55 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNF879B4DU55 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZNF879B4DU55 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZNF879B4DU55 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZNF879B4DU55 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
ZNF879B4DU55 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZNF879B4DU55 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZNF879B4DU55 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZNF879B4DU55 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZNF879B4DU55 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZNF879B4DU55 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZNF879B4DU55 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZNF879B4DU55 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZNF879B4DU55 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZNF879B4DU55 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZNF879B4DU55 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZNF879B4DU55 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZNF879B4DU55 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZNF879B4DU55 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZNF879B4DU55 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZNF879B4DU55 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZNF879B4DU55 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZNF879B4DU55 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZNF879B4DU55 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZNF879B4DU55 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZNF879B4DU55 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZNF879B4DU55 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
ZNF879B4DU55 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZNF879B4DU55 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZNF879B4DU55 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZNF879B4DU55 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZNF879B4DU55 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZNF879B4DU55 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZNF879B4DU55 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZNF879B4DU55 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZNF879B4DU55 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZNF879B4DU55 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ZNF879B4DU55 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ZNF879B4DU55 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ZNF879B4DU55 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ZNF879B4DU55 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ZNF879B4DU55 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
ZNF879B4DU55 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
ZNF879B4DU55 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ZNF879B4DU55 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ZNF879B4DU55 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.7 ms