Protein–RNA interactions for Protein: A8MW95

BECN2, Beclin-2, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BECN2A8MW95 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BECN2A8MW95 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BECN2A8MW95 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BECN2A8MW95 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
BECN2A8MW95 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
BECN2A8MW95 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
BECN2A8MW95 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BECN2A8MW95 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BECN2A8MW95 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BECN2A8MW95 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BECN2A8MW95 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BECN2A8MW95 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BECN2A8MW95 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BECN2A8MW95 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BECN2A8MW95 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
BECN2A8MW95 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BECN2A8MW95 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
BECN2A8MW95 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
BECN2A8MW95 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
BECN2A8MW95 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BECN2A8MW95 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
BECN2A8MW95 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BECN2A8MW95 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BECN2A8MW95 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
BECN2A8MW95 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BECN2A8MW95 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BECN2A8MW95 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BECN2A8MW95 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BECN2A8MW95 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BECN2A8MW95 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BECN2A8MW95 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BECN2A8MW95 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BECN2A8MW95 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BECN2A8MW95 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BECN2A8MW95 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BECN2A8MW95 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BECN2A8MW95 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
BECN2A8MW95 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
BECN2A8MW95 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BECN2A8MW95 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BECN2A8MW95 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BECN2A8MW95 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
BECN2A8MW95 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
BECN2A8MW95 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BECN2A8MW95 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BECN2A8MW95 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BECN2A8MW95 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BECN2A8MW95 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BECN2A8MW95 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BECN2A8MW95 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
BECN2A8MW95 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
BECN2A8MW95 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BECN2A8MW95 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BECN2A8MW95 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
BECN2A8MW95 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BECN2A8MW95 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
BECN2A8MW95 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BECN2A8MW95 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BECN2A8MW95 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BECN2A8MW95 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BECN2A8MW95 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BECN2A8MW95 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
BECN2A8MW95 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
BECN2A8MW95 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
BECN2A8MW95 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
BECN2A8MW95 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BECN2A8MW95 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
BECN2A8MW95 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BECN2A8MW95 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BECN2A8MW95 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BECN2A8MW95 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BECN2A8MW95 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
BECN2A8MW95 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
BECN2A8MW95 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BECN2A8MW95 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
BECN2A8MW95 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BECN2A8MW95 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
BECN2A8MW95 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
BECN2A8MW95 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
BECN2A8MW95 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
BECN2A8MW95 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
BECN2A8MW95 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
BECN2A8MW95 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
BECN2A8MW95 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
BECN2A8MW95 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
BECN2A8MW95 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
BECN2A8MW95 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
BECN2A8MW95 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BECN2A8MW95 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
BECN2A8MW95 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BECN2A8MW95 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BECN2A8MW95 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
BECN2A8MW95 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
BECN2A8MW95 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
BECN2A8MW95 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
BECN2A8MW95 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
BECN2A8MW95 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BECN2A8MW95 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
BECN2A8MW95 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
BECN2A8MW95 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms