Protein–RNA interactions for Protein: A6NKL6

TMEM200C, Transmembrane protein 200C, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM200CA6NKL6 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TMEM200CA6NKL6 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TMEM200CA6NKL6 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TMEM200CA6NKL6 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
TMEM200CA6NKL6 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TMEM200CA6NKL6 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TMEM200CA6NKL6 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TMEM200CA6NKL6 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TMEM200CA6NKL6 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
TMEM200CA6NKL6 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TMEM200CA6NKL6 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TMEM200CA6NKL6 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TMEM200CA6NKL6 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TMEM200CA6NKL6 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TMEM200CA6NKL6 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TMEM200CA6NKL6 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TMEM200CA6NKL6 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TMEM200CA6NKL6 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TMEM200CA6NKL6 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TMEM200CA6NKL6 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TMEM200CA6NKL6 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TMEM200CA6NKL6 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TMEM200CA6NKL6 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TMEM200CA6NKL6 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TMEM200CA6NKL6 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TMEM200CA6NKL6 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TMEM200CA6NKL6 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TMEM200CA6NKL6 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TMEM200CA6NKL6 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TMEM200CA6NKL6 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TMEM200CA6NKL6 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TMEM200CA6NKL6 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TMEM200CA6NKL6 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TMEM200CA6NKL6 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TMEM200CA6NKL6 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
TMEM200CA6NKL6 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TMEM200CA6NKL6 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TMEM200CA6NKL6 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TMEM200CA6NKL6 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TMEM200CA6NKL6 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TMEM200CA6NKL6 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TMEM200CA6NKL6 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TMEM200CA6NKL6 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TMEM200CA6NKL6 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TMEM200CA6NKL6 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TMEM200CA6NKL6 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TMEM200CA6NKL6 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TMEM200CA6NKL6 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TMEM200CA6NKL6 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TMEM200CA6NKL6 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TMEM200CA6NKL6 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TMEM200CA6NKL6 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
TMEM200CA6NKL6 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TMEM200CA6NKL6 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TMEM200CA6NKL6 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TMEM200CA6NKL6 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TMEM200CA6NKL6 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TMEM200CA6NKL6 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMEM200CA6NKL6 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMEM200CA6NKL6 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMEM200CA6NKL6 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMEM200CA6NKL6 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMEM200CA6NKL6 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMEM200CA6NKL6 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMEM200CA6NKL6 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
TMEM200CA6NKL6 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
TMEM200CA6NKL6 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
TMEM200CA6NKL6 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
TMEM200CA6NKL6 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMEM200CA6NKL6 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMEM200CA6NKL6 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TMEM200CA6NKL6 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TMEM200CA6NKL6 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TMEM200CA6NKL6 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TMEM200CA6NKL6 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
TMEM200CA6NKL6 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TMEM200CA6NKL6 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
TMEM200CA6NKL6 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
TMEM200CA6NKL6 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
TMEM200CA6NKL6 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TMEM200CA6NKL6 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TMEM200CA6NKL6 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TMEM200CA6NKL6 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TMEM200CA6NKL6 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TMEM200CA6NKL6 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TMEM200CA6NKL6 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TMEM200CA6NKL6 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
TMEM200CA6NKL6 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
TMEM200CA6NKL6 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TMEM200CA6NKL6 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TMEM200CA6NKL6 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TMEM200CA6NKL6 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TMEM200CA6NKL6 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TMEM200CA6NKL6 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
TMEM200CA6NKL6 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
TMEM200CA6NKL6 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TMEM200CA6NKL6 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TMEM200CA6NKL6 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TMEM200CA6NKL6 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TMEM200CA6NKL6 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms