Protein–RNA interactions for Protein: A6NIX2

WTIP, Wilms tumor protein 1-interacting protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WTIPA6NIX2 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
WTIPA6NIX2 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.67■■■□□ 2.02
WTIPA6NIX2 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC27.67■■■□□ 2.02
WTIPA6NIX2 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
WTIPA6NIX2 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
WTIPA6NIX2 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
WTIPA6NIX2 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
WTIPA6NIX2 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
WTIPA6NIX2 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
WTIPA6NIX2 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
WTIPA6NIX2 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
WTIPA6NIX2 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
WTIPA6NIX2 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
WTIPA6NIX2 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
WTIPA6NIX2 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
WTIPA6NIX2 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
WTIPA6NIX2 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
WTIPA6NIX2 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
WTIPA6NIX2 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
WTIPA6NIX2 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
WTIPA6NIX2 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
WTIPA6NIX2 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
WTIPA6NIX2 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
WTIPA6NIX2 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
WTIPA6NIX2 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
WTIPA6NIX2 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
WTIPA6NIX2 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
WTIPA6NIX2 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
WTIPA6NIX2 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
WTIPA6NIX2 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
WTIPA6NIX2 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
WTIPA6NIX2 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
WTIPA6NIX2 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
WTIPA6NIX2 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
WTIPA6NIX2 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
WTIPA6NIX2 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
WTIPA6NIX2 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
WTIPA6NIX2 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
WTIPA6NIX2 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
WTIPA6NIX2 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
WTIPA6NIX2 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
WTIPA6NIX2 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
WTIPA6NIX2 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
WTIPA6NIX2 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
WTIPA6NIX2 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
WTIPA6NIX2 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
WTIPA6NIX2 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
WTIPA6NIX2 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
WTIPA6NIX2 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
WTIPA6NIX2 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
WTIPA6NIX2 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
WTIPA6NIX2 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
WTIPA6NIX2 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
WTIPA6NIX2 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
WTIPA6NIX2 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
WTIPA6NIX2 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
WTIPA6NIX2 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
WTIPA6NIX2 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
WTIPA6NIX2 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
WTIPA6NIX2 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
WTIPA6NIX2 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
WTIPA6NIX2 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
WTIPA6NIX2 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
WTIPA6NIX2 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
WTIPA6NIX2 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
WTIPA6NIX2 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
WTIPA6NIX2 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
WTIPA6NIX2 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
WTIPA6NIX2 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
WTIPA6NIX2 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
WTIPA6NIX2 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
WTIPA6NIX2 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
WTIPA6NIX2 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
WTIPA6NIX2 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
WTIPA6NIX2 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
WTIPA6NIX2 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
WTIPA6NIX2 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
WTIPA6NIX2 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
WTIPA6NIX2 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
WTIPA6NIX2 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
WTIPA6NIX2 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
WTIPA6NIX2 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
WTIPA6NIX2 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
WTIPA6NIX2 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
WTIPA6NIX2 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2
WTIPA6NIX2 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
WTIPA6NIX2 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
WTIPA6NIX2 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
WTIPA6NIX2 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC27.57■■■□□ 2
WTIPA6NIX2 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
WTIPA6NIX2 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
WTIPA6NIX2 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
WTIPA6NIX2 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
WTIPA6NIX2 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
WTIPA6NIX2 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
WTIPA6NIX2 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
WTIPA6NIX2 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
WTIPA6NIX2 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
WTIPA6NIX2 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
WTIPA6NIX2 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms