Protein–RNA interactions for Protein: A6NFI3

ZNF316, Zinc finger protein 316, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF316A6NFI3 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
ZNF316A6NFI3 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
ZNF316A6NFI3 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
ZNF316A6NFI3 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
ZNF316A6NFI3 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
ZNF316A6NFI3 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
ZNF316A6NFI3 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
ZNF316A6NFI3 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
ZNF316A6NFI3 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
ZNF316A6NFI3 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
ZNF316A6NFI3 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
ZNF316A6NFI3 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
ZNF316A6NFI3 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
ZNF316A6NFI3 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
ZNF316A6NFI3 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
ZNF316A6NFI3 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
ZNF316A6NFI3 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
ZNF316A6NFI3 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
ZNF316A6NFI3 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
ZNF316A6NFI3 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
ZNF316A6NFI3 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
ZNF316A6NFI3 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
ZNF316A6NFI3 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
ZNF316A6NFI3 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
ZNF316A6NFI3 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
ZNF316A6NFI3 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
ZNF316A6NFI3 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
ZNF316A6NFI3 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
ZNF316A6NFI3 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
ZNF316A6NFI3 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
ZNF316A6NFI3 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
ZNF316A6NFI3 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
ZNF316A6NFI3 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
ZNF316A6NFI3 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
ZNF316A6NFI3 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
ZNF316A6NFI3 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
ZNF316A6NFI3 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
ZNF316A6NFI3 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
ZNF316A6NFI3 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
ZNF316A6NFI3 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
ZNF316A6NFI3 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
ZNF316A6NFI3 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
ZNF316A6NFI3 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
ZNF316A6NFI3 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
ZNF316A6NFI3 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
ZNF316A6NFI3 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
ZNF316A6NFI3 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC32.02■■■□□ 2.72
ZNF316A6NFI3 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
ZNF316A6NFI3 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
ZNF316A6NFI3 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.72
ZNF316A6NFI3 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
ZNF316A6NFI3 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
ZNF316A6NFI3 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
ZNF316A6NFI3 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
ZNF316A6NFI3 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC32.01■■■□□ 2.71
ZNF316A6NFI3 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC32.01■■■□□ 2.71
ZNF316A6NFI3 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.71
ZNF316A6NFI3 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
ZNF316A6NFI3 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
ZNF316A6NFI3 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
ZNF316A6NFI3 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
ZNF316A6NFI3 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
ZNF316A6NFI3 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
ZNF316A6NFI3 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
ZNF316A6NFI3 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
ZNF316A6NFI3 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
ZNF316A6NFI3 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
ZNF316A6NFI3 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
ZNF316A6NFI3 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
ZNF316A6NFI3 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
ZNF316A6NFI3 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
ZNF316A6NFI3 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
ZNF316A6NFI3 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
ZNF316A6NFI3 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
ZNF316A6NFI3 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC31.99■■■□□ 2.71
ZNF316A6NFI3 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
ZNF316A6NFI3 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
ZNF316A6NFI3 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
ZNF316A6NFI3 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
ZNF316A6NFI3 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
ZNF316A6NFI3 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
ZNF316A6NFI3 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
ZNF316A6NFI3 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC31.98■■■□□ 2.71
ZNF316A6NFI3 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
ZNF316A6NFI3 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
ZNF316A6NFI3 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
ZNF316A6NFI3 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
ZNF316A6NFI3 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
ZNF316A6NFI3 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
ZNF316A6NFI3 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
ZNF316A6NFI3 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
ZNF316A6NFI3 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
ZNF316A6NFI3 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
ZNF316A6NFI3 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
ZNF316A6NFI3 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
ZNF316A6NFI3 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
ZNF316A6NFI3 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
ZNF316A6NFI3 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
ZNF316A6NFI3 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
ZNF316A6NFI3 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms