Protein–RNA interactions for Protein: A6NDN8

Putative ubiquitin-like protein FUBI-like protein ENSP00000310146, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A6NDN8 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
A6NDN8 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
A6NDN8 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
A6NDN8 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
A6NDN8 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
A6NDN8 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
A6NDN8 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
A6NDN8 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
A6NDN8 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
A6NDN8 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
A6NDN8 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
A6NDN8 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
A6NDN8 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
A6NDN8 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
A6NDN8 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
A6NDN8 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
A6NDN8 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
A6NDN8 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
A6NDN8 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
A6NDN8 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
A6NDN8 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
A6NDN8 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
A6NDN8 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
A6NDN8 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
A6NDN8 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
A6NDN8 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
A6NDN8 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
A6NDN8 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
A6NDN8 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
A6NDN8 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
A6NDN8 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
A6NDN8 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
A6NDN8 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
A6NDN8 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
A6NDN8 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
A6NDN8 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
A6NDN8 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
A6NDN8 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
A6NDN8 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
A6NDN8 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
A6NDN8 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
A6NDN8 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
A6NDN8 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
A6NDN8 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
A6NDN8 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
A6NDN8 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
A6NDN8 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
A6NDN8 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
A6NDN8 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
A6NDN8 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
A6NDN8 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
A6NDN8 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
A6NDN8 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
A6NDN8 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
A6NDN8 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
A6NDN8 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
A6NDN8 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
A6NDN8 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
A6NDN8 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
A6NDN8 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
A6NDN8 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
A6NDN8 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
A6NDN8 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
A6NDN8 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
A6NDN8 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
A6NDN8 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
A6NDN8 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
A6NDN8 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
A6NDN8 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
A6NDN8 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
A6NDN8 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
A6NDN8 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
A6NDN8 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
A6NDN8 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
A6NDN8 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
A6NDN8 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
A6NDN8 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
A6NDN8 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
A6NDN8 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
A6NDN8 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
A6NDN8 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
A6NDN8 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
A6NDN8 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
A6NDN8 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
A6NDN8 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
A6NDN8 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
A6NDN8 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
A6NDN8 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
A6NDN8 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
A6NDN8 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
A6NDN8 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
A6NDN8 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
A6NDN8 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
A6NDN8 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
A6NDN8 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
A6NDN8 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
A6NDN8 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
A6NDN8 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
A6NDN8 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
A6NDN8 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms