Protein–RNA interactions for Protein: A6NCW3

FAM231B, Protein FAM231B, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM231BA6NCW3 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM231BA6NCW3 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM231BA6NCW3 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM231BA6NCW3 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM231BA6NCW3 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM231BA6NCW3 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM231BA6NCW3 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM231BA6NCW3 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM231BA6NCW3 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM231BA6NCW3 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM231BA6NCW3 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FAM231BA6NCW3 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FAM231BA6NCW3 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FAM231BA6NCW3 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FAM231BA6NCW3 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FAM231BA6NCW3 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FAM231BA6NCW3 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FAM231BA6NCW3 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FAM231BA6NCW3 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FAM231BA6NCW3 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FAM231BA6NCW3 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FAM231BA6NCW3 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FAM231BA6NCW3 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FAM231BA6NCW3 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FAM231BA6NCW3 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FAM231BA6NCW3 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FAM231BA6NCW3 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FAM231BA6NCW3 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FAM231BA6NCW3 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FAM231BA6NCW3 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FAM231BA6NCW3 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FAM231BA6NCW3 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FAM231BA6NCW3 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FAM231BA6NCW3 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FAM231BA6NCW3 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FAM231BA6NCW3 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FAM231BA6NCW3 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FAM231BA6NCW3 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FAM231BA6NCW3 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FAM231BA6NCW3 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FAM231BA6NCW3 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FAM231BA6NCW3 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FAM231BA6NCW3 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FAM231BA6NCW3 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FAM231BA6NCW3 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FAM231BA6NCW3 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FAM231BA6NCW3 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FAM231BA6NCW3 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FAM231BA6NCW3 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FAM231BA6NCW3 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FAM231BA6NCW3 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FAM231BA6NCW3 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FAM231BA6NCW3 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FAM231BA6NCW3 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FAM231BA6NCW3 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FAM231BA6NCW3 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FAM231BA6NCW3 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FAM231BA6NCW3 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FAM231BA6NCW3 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FAM231BA6NCW3 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FAM231BA6NCW3 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FAM231BA6NCW3 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM231BA6NCW3 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM231BA6NCW3 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM231BA6NCW3 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM231BA6NCW3 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM231BA6NCW3 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM231BA6NCW3 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM231BA6NCW3 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM231BA6NCW3 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM231BA6NCW3 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM231BA6NCW3 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM231BA6NCW3 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM231BA6NCW3 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FAM231BA6NCW3 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FAM231BA6NCW3 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FAM231BA6NCW3 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FAM231BA6NCW3 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FAM231BA6NCW3 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FAM231BA6NCW3 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FAM231BA6NCW3 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FAM231BA6NCW3 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FAM231BA6NCW3 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FAM231BA6NCW3 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FAM231BA6NCW3 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FAM231BA6NCW3 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FAM231BA6NCW3 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FAM231BA6NCW3 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FAM231BA6NCW3 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAM231BA6NCW3 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAM231BA6NCW3 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAM231BA6NCW3 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAM231BA6NCW3 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
FAM231BA6NCW3 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAM231BA6NCW3 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAM231BA6NCW3 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAM231BA6NCW3 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAM231BA6NCW3 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAM231BA6NCW3 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAM231BA6NCW3 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms