Protein–RNA interactions for Protein: A3QJZ7

PRAMEF27, PRAME family member 27, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF27A3QJZ7 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PRAMEF27A3QJZ7 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PRAMEF27A3QJZ7 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PRAMEF27A3QJZ7 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PRAMEF27A3QJZ7 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PRAMEF27A3QJZ7 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PRAMEF27A3QJZ7 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PRAMEF27A3QJZ7 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PRAMEF27A3QJZ7 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PRAMEF27A3QJZ7 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PRAMEF27A3QJZ7 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PRAMEF27A3QJZ7 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PRAMEF27A3QJZ7 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PRAMEF27A3QJZ7 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PRAMEF27A3QJZ7 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PRAMEF27A3QJZ7 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PRAMEF27A3QJZ7 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PRAMEF27A3QJZ7 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PRAMEF27A3QJZ7 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PRAMEF27A3QJZ7 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PRAMEF27A3QJZ7 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PRAMEF27A3QJZ7 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PRAMEF27A3QJZ7 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PRAMEF27A3QJZ7 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
PRAMEF27A3QJZ7 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PRAMEF27A3QJZ7 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PRAMEF27A3QJZ7 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PRAMEF27A3QJZ7 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PRAMEF27A3QJZ7 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PRAMEF27A3QJZ7 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PRAMEF27A3QJZ7 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PRAMEF27A3QJZ7 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PRAMEF27A3QJZ7 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PRAMEF27A3QJZ7 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PRAMEF27A3QJZ7 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PRAMEF27A3QJZ7 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PRAMEF27A3QJZ7 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PRAMEF27A3QJZ7 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PRAMEF27A3QJZ7 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PRAMEF27A3QJZ7 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PRAMEF27A3QJZ7 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PRAMEF27A3QJZ7 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PRAMEF27A3QJZ7 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PRAMEF27A3QJZ7 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PRAMEF27A3QJZ7 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PRAMEF27A3QJZ7 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PRAMEF27A3QJZ7 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PRAMEF27A3QJZ7 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PRAMEF27A3QJZ7 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PRAMEF27A3QJZ7 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PRAMEF27A3QJZ7 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PRAMEF27A3QJZ7 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PRAMEF27A3QJZ7 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PRAMEF27A3QJZ7 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PRAMEF27A3QJZ7 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PRAMEF27A3QJZ7 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PRAMEF27A3QJZ7 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PRAMEF27A3QJZ7 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PRAMEF27A3QJZ7 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PRAMEF27A3QJZ7 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PRAMEF27A3QJZ7 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PRAMEF27A3QJZ7 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PRAMEF27A3QJZ7 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PRAMEF27A3QJZ7 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PRAMEF27A3QJZ7 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PRAMEF27A3QJZ7 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PRAMEF27A3QJZ7 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PRAMEF27A3QJZ7 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PRAMEF27A3QJZ7 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PRAMEF27A3QJZ7 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PRAMEF27A3QJZ7 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PRAMEF27A3QJZ7 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
PRAMEF27A3QJZ7 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PRAMEF27A3QJZ7 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PRAMEF27A3QJZ7 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PRAMEF27A3QJZ7 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PRAMEF27A3QJZ7 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PRAMEF27A3QJZ7 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
PRAMEF27A3QJZ7 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PRAMEF27A3QJZ7 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PRAMEF27A3QJZ7 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PRAMEF27A3QJZ7 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PRAMEF27A3QJZ7 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PRAMEF27A3QJZ7 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PRAMEF27A3QJZ7 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PRAMEF27A3QJZ7 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PRAMEF27A3QJZ7 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PRAMEF27A3QJZ7 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PRAMEF27A3QJZ7 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PRAMEF27A3QJZ7 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PRAMEF27A3QJZ7 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PRAMEF27A3QJZ7 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
PRAMEF27A3QJZ7 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PRAMEF27A3QJZ7 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PRAMEF27A3QJZ7 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PRAMEF27A3QJZ7 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PRAMEF27A3QJZ7 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PRAMEF27A3QJZ7 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PRAMEF27A3QJZ7 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PRAMEF27A3QJZ7 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms