Protein–RNA interactions for Protein: A2VCL2

CCDC162P, Coiled-coil domain-containing protein 162, humanhuman

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC162PA2VCL2 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC162PA2VCL2 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC162PA2VCL2 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC162PA2VCL2 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC162PA2VCL2 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC162PA2VCL2 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC162PA2VCL2 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC162PA2VCL2 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC162PA2VCL2 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC162PA2VCL2 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC162PA2VCL2 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC162PA2VCL2 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC162PA2VCL2 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC162PA2VCL2 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC162PA2VCL2 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC162PA2VCL2 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC162PA2VCL2 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC162PA2VCL2 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC162PA2VCL2 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC162PA2VCL2 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC162PA2VCL2 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC162PA2VCL2 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC162PA2VCL2 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC162PA2VCL2 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC162PA2VCL2 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC162PA2VCL2 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC162PA2VCL2 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC162PA2VCL2 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC162PA2VCL2 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC162PA2VCL2 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC162PA2VCL2 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC162PA2VCL2 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC162PA2VCL2 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC162PA2VCL2 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC162PA2VCL2 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC162PA2VCL2 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC162PA2VCL2 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC162PA2VCL2 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC162PA2VCL2 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC162PA2VCL2 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC162PA2VCL2 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC162PA2VCL2 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC162PA2VCL2 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC162PA2VCL2 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC162PA2VCL2 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC162PA2VCL2 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC162PA2VCL2 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC162PA2VCL2 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC162PA2VCL2 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC162PA2VCL2 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC162PA2VCL2 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC162PA2VCL2 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC162PA2VCL2 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC162PA2VCL2 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC162PA2VCL2 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC162PA2VCL2 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC162PA2VCL2 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC162PA2VCL2 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC162PA2VCL2 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC162PA2VCL2 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC162PA2VCL2 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC162PA2VCL2 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC162PA2VCL2 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC162PA2VCL2 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC162PA2VCL2 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC162PA2VCL2 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CCDC162PA2VCL2 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CCDC162PA2VCL2 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC162PA2VCL2 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC162PA2VCL2 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC162PA2VCL2 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC162PA2VCL2 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC162PA2VCL2 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC162PA2VCL2 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC162PA2VCL2 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC162PA2VCL2 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC162PA2VCL2 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC162PA2VCL2 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC162PA2VCL2 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC162PA2VCL2 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC162PA2VCL2 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC162PA2VCL2 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC162PA2VCL2 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC162PA2VCL2 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC162PA2VCL2 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC162PA2VCL2 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC162PA2VCL2 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC162PA2VCL2 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC162PA2VCL2 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC162PA2VCL2 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC162PA2VCL2 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC162PA2VCL2 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC162PA2VCL2 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC162PA2VCL2 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC162PA2VCL2 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC162PA2VCL2 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC162PA2VCL2 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC162PA2VCL2 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC162PA2VCL2 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC162PA2VCL2 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms