Protein–RNA interactions for Protein: A0A5B9

TRBC2, T-cell receptor beta-2 chain C region, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBC2A0A5B9 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRBC2A0A5B9 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRBC2A0A5B9 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRBC2A0A5B9 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRBC2A0A5B9 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRBC2A0A5B9 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRBC2A0A5B9 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRBC2A0A5B9 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRBC2A0A5B9 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRBC2A0A5B9 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRBC2A0A5B9 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
TRBC2A0A5B9 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRBC2A0A5B9 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRBC2A0A5B9 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRBC2A0A5B9 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRBC2A0A5B9 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRBC2A0A5B9 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRBC2A0A5B9 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRBC2A0A5B9 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRBC2A0A5B9 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRBC2A0A5B9 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRBC2A0A5B9 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRBC2A0A5B9 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRBC2A0A5B9 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRBC2A0A5B9 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRBC2A0A5B9 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRBC2A0A5B9 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRBC2A0A5B9 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRBC2A0A5B9 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRBC2A0A5B9 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRBC2A0A5B9 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRBC2A0A5B9 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRBC2A0A5B9 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRBC2A0A5B9 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRBC2A0A5B9 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRBC2A0A5B9 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRBC2A0A5B9 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRBC2A0A5B9 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRBC2A0A5B9 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRBC2A0A5B9 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TRBC2A0A5B9 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRBC2A0A5B9 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRBC2A0A5B9 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRBC2A0A5B9 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRBC2A0A5B9 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRBC2A0A5B9 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRBC2A0A5B9 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRBC2A0A5B9 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRBC2A0A5B9 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRBC2A0A5B9 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRBC2A0A5B9 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRBC2A0A5B9 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRBC2A0A5B9 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRBC2A0A5B9 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRBC2A0A5B9 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRBC2A0A5B9 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
TRBC2A0A5B9 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRBC2A0A5B9 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRBC2A0A5B9 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRBC2A0A5B9 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRBC2A0A5B9 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRBC2A0A5B9 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRBC2A0A5B9 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRBC2A0A5B9 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRBC2A0A5B9 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRBC2A0A5B9 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRBC2A0A5B9 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRBC2A0A5B9 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRBC2A0A5B9 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRBC2A0A5B9 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TRBC2A0A5B9 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRBC2A0A5B9 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRBC2A0A5B9 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRBC2A0A5B9 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRBC2A0A5B9 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRBC2A0A5B9 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRBC2A0A5B9 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRBC2A0A5B9 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRBC2A0A5B9 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRBC2A0A5B9 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRBC2A0A5B9 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRBC2A0A5B9 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRBC2A0A5B9 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRBC2A0A5B9 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRBC2A0A5B9 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRBC2A0A5B9 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRBC2A0A5B9 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
TRBC2A0A5B9 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRBC2A0A5B9 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRBC2A0A5B9 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRBC2A0A5B9 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRBC2A0A5B9 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRBC2A0A5B9 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRBC2A0A5B9 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRBC2A0A5B9 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRBC2A0A5B9 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRBC2A0A5B9 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRBC2A0A5B9 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRBC2A0A5B9 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRBC2A0A5B9 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms