Protein–RNA interactions for Protein: A0A1W2PPC4

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A1W2PPC4 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
A0A1W2PPC4 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
A0A1W2PPC4 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
A0A1W2PPC4 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
A0A1W2PPC4 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
A0A1W2PPC4 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
A0A1W2PPC4 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
A0A1W2PPC4 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
A0A1W2PPC4 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
A0A1W2PPC4 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
A0A1W2PPC4 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
A0A1W2PPC4 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
A0A1W2PPC4 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
A0A1W2PPC4 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
A0A1W2PPC4 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
A0A1W2PPC4 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
A0A1W2PPC4 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
A0A1W2PPC4 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
A0A1W2PPC4 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
A0A1W2PPC4 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
A0A1W2PPC4 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
A0A1W2PPC4 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
A0A1W2PPC4 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
A0A1W2PPC4 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
A0A1W2PPC4 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
A0A1W2PPC4 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
A0A1W2PPC4 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
A0A1W2PPC4 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
A0A1W2PPC4 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
A0A1W2PPC4 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
A0A1W2PPC4 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
A0A1W2PPC4 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
A0A1W2PPC4 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
A0A1W2PPC4 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
A0A1W2PPC4 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
A0A1W2PPC4 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
A0A1W2PPC4 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
A0A1W2PPC4 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
A0A1W2PPC4 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
A0A1W2PPC4 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
A0A1W2PPC4 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
A0A1W2PPC4 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
A0A1W2PPC4 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
A0A1W2PPC4 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
A0A1W2PPC4 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
A0A1W2PPC4 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
A0A1W2PPC4 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
A0A1W2PPC4 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
A0A1W2PPC4 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
A0A1W2PPC4 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
A0A1W2PPC4 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
A0A1W2PPC4 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
A0A1W2PPC4 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
A0A1W2PPC4 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
A0A1W2PPC4 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
A0A1W2PPC4 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
A0A1W2PPC4 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
A0A1W2PPC4 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
A0A1W2PPC4 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
A0A1W2PPC4 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
A0A1W2PPC4 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
A0A1W2PPC4 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
A0A1W2PPC4 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
A0A1W2PPC4 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
A0A1W2PPC4 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
A0A1W2PPC4 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
A0A1W2PPC4 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
A0A1W2PPC4 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
A0A1W2PPC4 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
A0A1W2PPC4 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
A0A1W2PPC4 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
A0A1W2PPC4 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
A0A1W2PPC4 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
A0A1W2PPC4 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
A0A1W2PPC4 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
A0A1W2PPC4 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
A0A1W2PPC4 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
A0A1W2PPC4 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
A0A1W2PPC4 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
A0A1W2PPC4 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
A0A1W2PPC4 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
A0A1W2PPC4 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
A0A1W2PPC4 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
A0A1W2PPC4 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
A0A1W2PPC4 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
A0A1W2PPC4 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
A0A1W2PPC4 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
A0A1W2PPC4 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
A0A1W2PPC4 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
A0A1W2PPC4 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
A0A1W2PPC4 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
A0A1W2PPC4 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
A0A1W2PPC4 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
A0A1W2PPC4 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
A0A1W2PPC4 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
A0A1W2PPC4 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
A0A1W2PPC4 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
A0A1W2PPC4 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
A0A1W2PPC4 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
A0A1W2PPC4 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.4 ms