Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3F1

Putative TAP2-associated 6.5 kDa polypeptide, humanhuman

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Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9Y3F1 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 AC009542.1-201ENST00000412549 1810 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 GZMB-201ENST00000216341 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 VPS28-201ENST00000292510 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 DPPA5-201ENST00000370370 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 C6orf48-202ENST00000375635 610 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 VPS28-202ENST00000377348 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 CCL19-202ENST00000378800 414 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 PRR23A-201ENST00000383163 801 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 C6orf48-209ENST00000395789 952 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 MRPS12-202ENST00000402029 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 MPV17-209ENST00000405983 859 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 PPIL3-205ENST00000409449 756 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 AL513165.1-201ENST00000413915 289 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 AL158207.2-201ENST00000414926 266 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 HNRNPA3P12-201ENST00000437410 1063 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 AC022274.1-201ENST00000467082 490 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 AC138409.2-203ENST00000508395 553 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 AC022182.2-201ENST00000525556 859 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 VPS28-210ENST00000529182 1010 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 LINC02369-202ENST00000540745 801 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 SLC25A3-206ENST00000547534 556 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 SRP14-208ENST00000560773 468 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 AC120498.7-201ENST00000562876 330 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 FBXO36P1-201ENST00000579006 471 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 ANAPC11-221ENST00000584314 559 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 AC010127.1-202ENST00000597623 713 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 CRABP2-204ENST00000621784 1033 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 AL590094.1-208ENST00000636917 627 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 FBXO16-202ENST00000380254 1343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 TRO-225ENST00000622017 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 PLEKHG6-201ENST00000011684 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 LIMS4-204ENST00000632897 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 LINC01922-202ENST00000567168 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 PRKACB-205ENST00000370688 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 CLUL1-202ENST00000400606 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 RNF121-211ENST00000530137 2202 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 UBE2V1-224ENST00000625172 2297 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 PIGV-202ENST00000374145 2713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 HMGCS2-201ENST00000369406 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 GFI1B-203ENST00000372123 1514 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 CELA3A-202ENST00000374663 649 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 UBIAD1-201ENST00000376804 825 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 FAM153C-201ENST00000398106 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 KRT18P33-201ENST00000398525 1043 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 AL157823.1-201ENST00000403727 628 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 GRHL1-202ENST00000405379 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 SDCBP2P1-201ENST00000416115 614 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 SHISA5-206ENST00000426002 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 CKMT2-203ENST00000437669 1479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 CCND3P1-201ENST00000438347 580 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 LINC00399-201ENST00000439008 414 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 GSS-202ENST00000451957 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 RPL29P2-201ENST00000488409 460 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 RCC2P5-201ENST00000492126 1487 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
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