Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBK2

PPARGC1A, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGC1AQ9UBK2 RIC1-204ENST00000418622 6658 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PPARGC1AQ9UBK2 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PPARGC1AQ9UBK2 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PPARGC1AQ9UBK2 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PPARGC1AQ9UBK2 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PPARGC1AQ9UBK2 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PPARGC1AQ9UBK2 CCSER2-203ENST00000372088 7657 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PPARGC1AQ9UBK2 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
PPARGC1AQ9UBK2 EDEM3-201ENST00000318130 6898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PPARGC1AQ9UBK2 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PPARGC1AQ9UBK2 PTPA-205ENST00000357197 2653 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PPARGC1AQ9UBK2 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PPARGC1AQ9UBK2 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PPARGC1AQ9UBK2 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PPARGC1AQ9UBK2 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PPARGC1AQ9UBK2 SMARCA2-208ENST00000382194 5679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PPARGC1AQ9UBK2 DAGLB-201ENST00000297056 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PPARGC1AQ9UBK2 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PPARGC1AQ9UBK2 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PPARGC1AQ9UBK2 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PPARGC1AQ9UBK2 TRIM10-204ENST00000449742 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PPARGC1AQ9UBK2 TP73-211ENST00000604074 4806 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PPARGC1AQ9UBK2 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PPARGC1AQ9UBK2 RIC1-203ENST00000414202 6774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PPARGC1AQ9UBK2 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PPARGC1AQ9UBK2 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PPARGC1AQ9UBK2 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
PPARGC1AQ9UBK2 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PPARGC1AQ9UBK2 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PPARGC1AQ9UBK2 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PPARGC1AQ9UBK2 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PPARGC1AQ9UBK2 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PPARGC1AQ9UBK2 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PPARGC1AQ9UBK2 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PPARGC1AQ9UBK2 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
PPARGC1AQ9UBK2 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PPARGC1AQ9UBK2 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PPARGC1AQ9UBK2 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PPARGC1AQ9UBK2 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PPARGC1AQ9UBK2 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PPARGC1AQ9UBK2 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PPARGC1AQ9UBK2 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PPARGC1AQ9UBK2 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PPARGC1AQ9UBK2 ACAN-209ENST00000617301 8669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PPARGC1AQ9UBK2 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PPARGC1AQ9UBK2 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PPARGC1AQ9UBK2 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PPARGC1AQ9UBK2 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PPARGC1AQ9UBK2 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PPARGC1AQ9UBK2 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PPARGC1AQ9UBK2 FHOD3-201ENST00000257209 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PPARGC1AQ9UBK2 ADAMTS13-202ENST00000356589 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PPARGC1AQ9UBK2 ADAMTSL4-203ENST00000369039 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PPARGC1AQ9UBK2 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PPARGC1AQ9UBK2 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PPARGC1AQ9UBK2 IFITM10-201ENST00000340134 3706 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PPARGC1AQ9UBK2 CNTN1-203ENST00000547702 3033 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PPARGC1AQ9UBK2 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PPARGC1AQ9UBK2 MAP3K21-202ENST00000366623 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PPARGC1AQ9UBK2 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PPARGC1AQ9UBK2 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PPARGC1AQ9UBK2 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PPARGC1AQ9UBK2 PDE2A-206ENST00000444035 4193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PPARGC1AQ9UBK2 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PPARGC1AQ9UBK2 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PPARGC1AQ9UBK2 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PPARGC1AQ9UBK2 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PPARGC1AQ9UBK2 EHMT2-204ENST00000395728 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PPARGC1AQ9UBK2 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PPARGC1AQ9UBK2 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PPARGC1AQ9UBK2 ADCY8-202ENST00000377928 3363 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PPARGC1AQ9UBK2 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PPARGC1AQ9UBK2 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PPARGC1AQ9UBK2 PHLDB2-204ENST00000431670 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PPARGC1AQ9UBK2 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PPARGC1AQ9UBK2 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PPARGC1AQ9UBK2 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PPARGC1AQ9UBK2 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PPARGC1AQ9UBK2 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PPARGC1AQ9UBK2 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PPARGC1AQ9UBK2 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PPARGC1AQ9UBK2 KRT18P15-201ENST00000458108 1291 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
PPARGC1AQ9UBK2 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PPARGC1AQ9UBK2 AL512310.5-201ENST00000551999 515 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
PPARGC1AQ9UBK2 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PPARGC1AQ9UBK2 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PPARGC1AQ9UBK2 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PPARGC1AQ9UBK2 ASNA1-205ENST00000611688 1214 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PPARGC1AQ9UBK2 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
PPARGC1AQ9UBK2 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PPARGC1AQ9UBK2 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PPARGC1AQ9UBK2 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PPARGC1AQ9UBK2 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PPARGC1AQ9UBK2 MED12L-202ENST00000309237 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PPARGC1AQ9UBK2 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PPARGC1AQ9UBK2 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
PPARGC1AQ9UBK2 TNK1-207ENST00000576812 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PPARGC1AQ9UBK2 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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