Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2M1

LRP2BP, LRP2-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP2BPQ9P2M1 SEC61B-201ENST00000223641 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRP2BPQ9P2M1 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRP2BPQ9P2M1 RAB25-201ENST00000361084 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRP2BPQ9P2M1 TCEA3-201ENST00000374601 1197 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRP2BPQ9P2M1 AL935212.1-201ENST00000377548 906 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRP2BPQ9P2M1 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRP2BPQ9P2M1 AC092638.2-201ENST00000441105 947 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
LRP2BPQ9P2M1 RN7SL767P-201ENST00000493013 295 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
LRP2BPQ9P2M1 SEC61B-203ENST00000498603 587 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRP2BPQ9P2M1 NDRG1-209ENST00000518176 888 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRP2BPQ9P2M1 AC020934.2-201ENST00000592400 456 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRP2BPQ9P2M1 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRP2BPQ9P2M1 BAP1-211ENST00000615113 489 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
LRP2BPQ9P2M1 HPX-213ENST00000615166 826 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRP2BPQ9P2M1 MIR6858-201ENST00000620733 67 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
LRP2BPQ9P2M1 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRP2BPQ9P2M1 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRP2BPQ9P2M1 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRP2BPQ9P2M1 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
LRP2BPQ9P2M1 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRP2BPQ9P2M1 FMR1-215ENST00000616382 1648 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRP2BPQ9P2M1 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
LRP2BPQ9P2M1 AC004997.1-205ENST00000447976 1851 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRP2BPQ9P2M1 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRP2BPQ9P2M1 CCDC51-206ENST00000447018 1461 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRP2BPQ9P2M1 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRP2BPQ9P2M1 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRP2BPQ9P2M1 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRP2BPQ9P2M1 FXYD3-208ENST00000604404 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRP2BPQ9P2M1 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRP2BPQ9P2M1 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRP2BPQ9P2M1 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRP2BPQ9P2M1 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRP2BPQ9P2M1 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRP2BPQ9P2M1 DPEP2-202ENST00000393847 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRP2BPQ9P2M1 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRP2BPQ9P2M1 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRP2BPQ9P2M1 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRP2BPQ9P2M1 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
LRP2BPQ9P2M1 MS4A15-201ENST00000337911 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRP2BPQ9P2M1 PHB-210ENST00000511832 1509 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRP2BPQ9P2M1 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRP2BPQ9P2M1 SPACA3-201ENST00000269053 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRP2BPQ9P2M1 OR2V1-201ENST00000329365 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRP2BPQ9P2M1 CSAG1-203ENST00000370291 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRP2BPQ9P2M1 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRP2BPQ9P2M1 SPIN2B-203ENST00000374910 725 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRP2BPQ9P2M1 STX1A-202ENST00000395154 1022 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRP2BPQ9P2M1 AL356056.1-201ENST00000437899 369 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRP2BPQ9P2M1 CSNK1G2P1-201ENST00000442675 955 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
LRP2BPQ9P2M1 AL356218.1-201ENST00000450864 353 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRP2BPQ9P2M1 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRP2BPQ9P2M1 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRP2BPQ9P2M1 HINT1-205ENST00000508488 703 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRP2BPQ9P2M1 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRP2BPQ9P2M1 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRP2BPQ9P2M1 KRT8P2-201ENST00000556193 944 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
LRP2BPQ9P2M1 AC068867.1-201ENST00000559855 150 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
LRP2BPQ9P2M1 AC132825.4-202ENST00000578792 434 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
LRP2BPQ9P2M1 SPACA3-205ENST00000580599 949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRP2BPQ9P2M1 AC140113.1-201ENST00000603467 169 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
LRP2BPQ9P2M1 RPS10-207ENST00000621356 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRP2BPQ9P2M1 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
LRP2BPQ9P2M1 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRP2BPQ9P2M1 AC237221.1-201ENST00000561575 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRP2BPQ9P2M1 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRP2BPQ9P2M1 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRP2BPQ9P2M1 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRP2BPQ9P2M1 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRP2BPQ9P2M1 MINDY4B-201ENST00000465419 1383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRP2BPQ9P2M1 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRP2BPQ9P2M1 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRP2BPQ9P2M1 ERLIN1-202ENST00000407654 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRP2BPQ9P2M1 ERCC1-208ENST00000589165 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRP2BPQ9P2M1 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRP2BPQ9P2M1 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRP2BPQ9P2M1 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRP2BPQ9P2M1 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LRP2BPQ9P2M1 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LRP2BPQ9P2M1 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LRP2BPQ9P2M1 PDXDC2P-206ENST00000534700 1315 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
LRP2BPQ9P2M1 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LRP2BPQ9P2M1 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LRP2BPQ9P2M1 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LRP2BPQ9P2M1 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
LRP2BPQ9P2M1 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LRP2BPQ9P2M1 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LRP2BPQ9P2M1 AC019109.1-201ENST00000401725 1874 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
LRP2BPQ9P2M1 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LRP2BPQ9P2M1 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LRP2BPQ9P2M1 CHCHD7-202ENST00000355315 1535 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LRP2BPQ9P2M1 GOLGA8EP-201ENST00000530246 1959 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
LRP2BPQ9P2M1 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LRP2BPQ9P2M1 ODCP-201ENST00000459650 1639 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
LRP2BPQ9P2M1 FGD4-203ENST00000472289 1629 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LRP2BPQ9P2M1 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
LRP2BPQ9P2M1 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LRP2BPQ9P2M1 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LRP2BPQ9P2M1 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LRP2BPQ9P2M1 SELENOV-202ENST00000423711 1701 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms