Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSW2

CRACR2A, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRACR2AQ9BSW2 DPP3-209ENST00000531863 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CRACR2AQ9BSW2 EPHB1-201ENST00000398015 4672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CRACR2AQ9BSW2 ZDHHC6-202ENST00000369405 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CRACR2AQ9BSW2 PLIN3-207ENST00000592528 2154 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CRACR2AQ9BSW2 ZNF75A-205ENST00000574298 2347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CRACR2AQ9BSW2 PTK7-205ENST00000352931 4023 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CRACR2AQ9BSW2 TSN-212ENST00000536142 3328 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CRACR2AQ9BSW2 PPM1M-203ENST00000409502 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
CRACR2AQ9BSW2 DSTN-201ENST00000246069 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
CRACR2AQ9BSW2 AC073869.1-201ENST00000415574 2762 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CRACR2AQ9BSW2 SLC46A1-208ENST00000618626 5363 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CRACR2AQ9BSW2 CDH16-204ENST00000565796 2694 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CRACR2AQ9BSW2 USP19-202ENST00000398888 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CRACR2AQ9BSW2 LRRC8C-201ENST00000370454 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CRACR2AQ9BSW2 SGMS1-202ENST00000361781 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CRACR2AQ9BSW2 GOLGA7B-203ENST00000596005 6378 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CRACR2AQ9BSW2 PRKAR1A-203ENST00000392711 4327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CRACR2AQ9BSW2 AMT-201ENST00000273588 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CRACR2AQ9BSW2 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CRACR2AQ9BSW2 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CRACR2AQ9BSW2 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CRACR2AQ9BSW2 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CRACR2AQ9BSW2 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CRACR2AQ9BSW2 ZBED6CL-201ENST00000343855 2933 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CRACR2AQ9BSW2 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CRACR2AQ9BSW2 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CRACR2AQ9BSW2 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CRACR2AQ9BSW2 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CRACR2AQ9BSW2 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CRACR2AQ9BSW2 RRN3P3-202ENST00000551766 3366 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CRACR2AQ9BSW2 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CRACR2AQ9BSW2 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CRACR2AQ9BSW2 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CRACR2AQ9BSW2 BAP1-211ENST00000615113 489 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CRACR2AQ9BSW2 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CRACR2AQ9BSW2 AC118758.2-201ENST00000614242 2813 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CRACR2AQ9BSW2 GIT2-201ENST00000320063 2094 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CRACR2AQ9BSW2 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CRACR2AQ9BSW2 CD276-202ENST00000318443 3469 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CRACR2AQ9BSW2 SLC46A3-201ENST00000266943 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CRACR2AQ9BSW2 ZNRF3-202ENST00000406323 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CRACR2AQ9BSW2 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CRACR2AQ9BSW2 ENDOV-207ENST00000518907 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CRACR2AQ9BSW2 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CRACR2AQ9BSW2 FLAD1-206ENST00000368432 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CRACR2AQ9BSW2 SUSD6-201ENST00000342745 5388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CRACR2AQ9BSW2 SLC8A2-203ENST00000542837 3603 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CRACR2AQ9BSW2 KARS-201ENST00000302445 2005 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CRACR2AQ9BSW2 PIK3R5-216ENST00000584803 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CRACR2AQ9BSW2 PPP3R1-201ENST00000234310 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CRACR2AQ9BSW2 CACNA1C-211ENST00000399617 7482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CRACR2AQ9BSW2 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CRACR2AQ9BSW2 AC004241.5-201ENST00000623870 2448 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CRACR2AQ9BSW2 HFE-202ENST00000317896 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CRACR2AQ9BSW2 TCN2-202ENST00000405742 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CRACR2AQ9BSW2 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CRACR2AQ9BSW2 ZHX1-202ENST00000395571 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CRACR2AQ9BSW2 TYK2-205ENST00000525621 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CRACR2AQ9BSW2 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CRACR2AQ9BSW2 C11orf21-201ENST00000381153 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CRACR2AQ9BSW2 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CRACR2AQ9BSW2 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CRACR2AQ9BSW2 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CRACR2AQ9BSW2 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CRACR2AQ9BSW2 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CRACR2AQ9BSW2 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CRACR2AQ9BSW2 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CRACR2AQ9BSW2 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CRACR2AQ9BSW2 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CRACR2AQ9BSW2 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CRACR2AQ9BSW2 HNRNPLL-209ENST00000449105 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CRACR2AQ9BSW2 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CRACR2AQ9BSW2 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CRACR2AQ9BSW2 GNAO1-214ENST00000638705 3529 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CRACR2AQ9BSW2 ALPK3-201ENST00000258888 10917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CRACR2AQ9BSW2 SETD1B-202ENST00000542440 8185 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CRACR2AQ9BSW2 ZNF609-202ENST00000416172 3863 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CRACR2AQ9BSW2 CRELD1-202ENST00000383811 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CRACR2AQ9BSW2 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CRACR2AQ9BSW2 PCDHGA3-201ENST00000253812 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CRACR2AQ9BSW2 CELSR1-201ENST00000262738 11389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CRACR2AQ9BSW2 SPHK2-206ENST00000598088 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CRACR2AQ9BSW2 SLC22A5-201ENST00000245407 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CRACR2AQ9BSW2 MEGF11-201ENST00000288745 5707 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CRACR2AQ9BSW2 KDM8-212ENST00000568965 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CRACR2AQ9BSW2 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CRACR2AQ9BSW2 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CRACR2AQ9BSW2 C7orf65-201ENST00000408988 2911 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CRACR2AQ9BSW2 SLC9A3P3-201ENST00000457608 2229 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CRACR2AQ9BSW2 AC134312.1-201ENST00000378417 3468 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CRACR2AQ9BSW2 ZDHHC8-203ENST00000405930 3112 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CRACR2AQ9BSW2 TLE3-211ENST00000557997 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CRACR2AQ9BSW2 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CRACR2AQ9BSW2 NFATC2-203ENST00000414705 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CRACR2AQ9BSW2 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CRACR2AQ9BSW2 NOB1-201ENST00000268802 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CRACR2AQ9BSW2 IRF6-204ENST00000542854 4256 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CRACR2AQ9BSW2 ZNF135-205ENST00000511556 2253 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CRACR2AQ9BSW2 RREB1-210ENST00000611109 3563 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CRACR2AQ9BSW2 ALCAM-201ENST00000306107 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms