Protein–RNA interactions for Protein: Q96DB2

HDAC11, Histone deacetylase 11, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC11Q96DB2 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 IL18BP-205ENST00000393705 1549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 NPR1-202ENST00000368680 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 REXO1L1P-201ENST00000379010 6598 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 NOB1-201ENST00000268802 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 SELENOV-202ENST00000423711 1701 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 EMILIN1-201ENST00000380320 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 NEK9-201ENST00000238616 8310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 TCN2-202ENST00000405742 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 TACC3-212ENST00000612220 1756 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 OR2C3-204ENST00000641802 8509 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 AC046130.1-201ENST00000501954 2179 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 PRKAR1A-203ENST00000392711 4327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 AC072061.1-201ENST00000569710 2234 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 SEC14L5-201ENST00000251170 6459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 NEU3-201ENST00000294064 6728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 ZNF75A-205ENST00000574298 2347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 DISC1-206ENST00000366637 6848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 SEZ6L-203ENST00000360929 6307 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 AMT-256ENST00000638063 1783 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 DNM3-202ENST00000367731 7613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 NCOR2-208ENST00000429285 8475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 PASK-204ENST00000405260 4942 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 HELLS-202ENST00000348459 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 DSCAML1-203ENST00000527706 6099 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 AL359075.1-201ENST00000476232 2921 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 WNT7A-201ENST00000285018 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 MYO15B-236ENST00000633867 6323 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 PLXNB1-201ENST00000296440 7143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 TP73-201ENST00000346387 4854 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 PKP1-203ENST00000367324 5384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 CEP95-212ENST00000581056 903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.5 ms