Protein–RNA interactions for Protein: Q92995

USP13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 863 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP13Q92995 MIR645-201ENST00000385283 94 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
USP13Q92995 AL512330.1-201ENST00000456701 349 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
USP13Q92995 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
USP13Q92995 RTN4RL2-203ENST00000533205 637 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
USP13Q92995 TMEM14C-205ENST00000541412 1177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
USP13Q92995 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
USP13Q92995 AC073573.1-201ENST00000550908 481 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
USP13Q92995 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
USP13Q92995 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
USP13Q92995 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
USP13Q92995 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
USP13Q92995 AC242426.4-201ENST00000606856 573 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
USP13Q92995 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
USP13Q92995 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
USP13Q92995 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
USP13Q92995 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
USP13Q92995 SLC25A19-205ENST00000442286 1496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
USP13Q92995 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
USP13Q92995 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
USP13Q92995 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
USP13Q92995 SLC6A9-207ENST00000475075 1881 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
USP13Q92995 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
USP13Q92995 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
USP13Q92995 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
USP13Q92995 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
USP13Q92995 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
USP13Q92995 METTL17-201ENST00000339374 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
USP13Q92995 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
USP13Q92995 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
USP13Q92995 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
USP13Q92995 SUCO-201ENST00000263688 5556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
USP13Q92995 MANEAL-201ENST00000329006 1930 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
USP13Q92995 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
USP13Q92995 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
USP13Q92995 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
USP13Q92995 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
USP13Q92995 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
USP13Q92995 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
USP13Q92995 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
USP13Q92995 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
USP13Q92995 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
USP13Q92995 SPACA3-201ENST00000269053 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
USP13Q92995 COX14-201ENST00000317943 708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
USP13Q92995 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
USP13Q92995 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
USP13Q92995 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
USP13Q92995 HLA-DMA-203ENST00000395305 777 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
USP13Q92995 HIST2H2BA-201ENST00000412169 381 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
USP13Q92995 DCAF7-201ENST00000415273 1220 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
USP13Q92995 AC145207.1-201ENST00000415556 691 ntTSL 4 BASIC14.86□□□□□ -0.03
USP13Q92995 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
USP13Q92995 RPL18AP8-201ENST00000486071 528 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
USP13Q92995 OSMR-AS1-202ENST00000512519 837 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
USP13Q92995 TMCO5B-205ENST00000530020 894 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
USP13Q92995 AL845331.2-201ENST00000561882 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
USP13Q92995 SPACA3-205ENST00000580599 949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
USP13Q92995 MIR3180-2-201ENST00000581748 88 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
USP13Q92995 SNHG25-202ENST00000582965 278 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
USP13Q92995 LINC01224-201ENST00000593573 798 ntTSL 4 BASIC14.86□□□□□ -0.03
USP13Q92995 AC107464.3-201ENST00000609172 737 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
USP13Q92995 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
USP13Q92995 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
USP13Q92995 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
USP13Q92995 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
USP13Q92995 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
USP13Q92995 AC109460.1-201ENST00000567209 1478 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
USP13Q92995 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
USP13Q92995 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
USP13Q92995 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
USP13Q92995 TAGLN3-201ENST00000273368 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
USP13Q92995 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
USP13Q92995 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
USP13Q92995 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
USP13Q92995 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
USP13Q92995 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
USP13Q92995 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
USP13Q92995 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
USP13Q92995 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
USP13Q92995 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
USP13Q92995 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
USP13Q92995 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
USP13Q92995 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
USP13Q92995 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
USP13Q92995 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
USP13Q92995 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
USP13Q92995 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
USP13Q92995 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
USP13Q92995 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
USP13Q92995 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
USP13Q92995 CALR3-201ENST00000269881 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
USP13Q92995 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
USP13Q92995 AZGP1P1-202ENST00000425474 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
USP13Q92995 AC013448.2-201ENST00000440341 787 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
USP13Q92995 Z99943.1-201ENST00000451545 718 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
USP13Q92995 AC093627.2-201ENST00000497017 568 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
USP13Q92995 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
USP13Q92995 LINC01629-201ENST00000553613 581 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
USP13Q92995 SMIM6-201ENST00000556126 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
USP13Q92995 GMFG-209ENST00000600322 622 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
USP13Q92995 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.1 ms