Protein–RNA interactions for Protein: Q8WYN3

CSRNP3, Cysteine/serine-rich nuclear protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRNP3Q8WYN3 GOLGA2P7-209ENST00000560408 745 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CSRNP3Q8WYN3 AC079414.2-201ENST00000567157 1104 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CSRNP3Q8WYN3 MIR3940-201ENST00000579148 102 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CSRNP3Q8WYN3 AC055811.3-201ENST00000584952 686 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CSRNP3Q8WYN3 TUBB6-214ENST00000592683 481 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSRNP3Q8WYN3 SRSF3-208ENST00000620941 869 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSRNP3Q8WYN3 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSRNP3Q8WYN3 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSRNP3Q8WYN3 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSRNP3Q8WYN3 MC5R-201ENST00000324750 1319 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSRNP3Q8WYN3 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSRNP3Q8WYN3 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSRNP3Q8WYN3 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSRNP3Q8WYN3 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSRNP3Q8WYN3 Z84468.1-201ENST00000626321 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSRNP3Q8WYN3 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSRNP3Q8WYN3 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSRNP3Q8WYN3 TMEM56-RWDD3-202ENST00000604534 1491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSRNP3Q8WYN3 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CSRNP3Q8WYN3 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CSRNP3Q8WYN3 CWC27-201ENST00000381070 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CSRNP3Q8WYN3 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CSRNP3Q8WYN3 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CSRNP3Q8WYN3 LINC01535-206ENST00000592712 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CSRNP3Q8WYN3 NHP2-202ENST00000314397 599 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CSRNP3Q8WYN3 IFNLR1-203ENST00000374418 674 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CSRNP3Q8WYN3 AP001057.1-201ENST00000437557 799 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CSRNP3Q8WYN3 AL121656.1-201ENST00000440786 482 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CSRNP3Q8WYN3 BPIFB5P-201ENST00000457066 1099 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CSRNP3Q8WYN3 TRPC7-AS1-201ENST00000514459 460 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CSRNP3Q8WYN3 C12orf57-204ENST00000540506 551 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CSRNP3Q8WYN3 C17orf62-216ENST00000578919 841 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CSRNP3Q8WYN3 AP005131.2-201ENST00000589045 487 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CSRNP3Q8WYN3 AC011247.3-201ENST00000603297 438 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CSRNP3Q8WYN3 AC026120.2-201ENST00000617239 309 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CSRNP3Q8WYN3 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CSRNP3Q8WYN3 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CSRNP3Q8WYN3 SFXN4-201ENST00000355697 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CSRNP3Q8WYN3 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CSRNP3Q8WYN3 SULT2A1-201ENST00000222002 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CSRNP3Q8WYN3 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CSRNP3Q8WYN3 AF013593.1-201ENST00000458074 1487 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CSRNP3Q8WYN3 ATP6V0A4-202ENST00000353492 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CSRNP3Q8WYN3 MORN4-201ENST00000307450 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSRNP3Q8WYN3 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSRNP3Q8WYN3 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSRNP3Q8WYN3 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSRNP3Q8WYN3 AGAP10P-201ENST00000454844 2418 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CSRNP3Q8WYN3 LDB3-207ENST00000542786 1889 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSRNP3Q8WYN3 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSRNP3Q8WYN3 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSRNP3Q8WYN3 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSRNP3Q8WYN3 AL589935.1-203ENST00000412751 465 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSRNP3Q8WYN3 AC016903.2-201ENST00000456384 326 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSRNP3Q8WYN3 AC010186.1-201ENST00000546259 532 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSRNP3Q8WYN3 AL359219.1-201ENST00000556311 934 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CSRNP3Q8WYN3 INCA1-203ENST00000575780 1221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSRNP3Q8WYN3 NMRK2-202ENST00000593949 869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSRNP3Q8WYN3 NMRK2-204ENST00000599576 691 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSRNP3Q8WYN3 AC011451.3-201ENST00000634951 582 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSRNP3Q8WYN3 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSRNP3Q8WYN3 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSRNP3Q8WYN3 RCC2P5-201ENST00000492126 1487 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CSRNP3Q8WYN3 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSRNP3Q8WYN3 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSRNP3Q8WYN3 LIMS2-206ENST00000409754 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSRNP3Q8WYN3 IFT22-210ENST00000517481 1657 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSRNP3Q8WYN3 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSRNP3Q8WYN3 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSRNP3Q8WYN3 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSRNP3Q8WYN3 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CSRNP3Q8WYN3 NEK3-210ENST00000620675 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CSRNP3Q8WYN3 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CSRNP3Q8WYN3 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CSRNP3Q8WYN3 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CSRNP3Q8WYN3 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CSRNP3Q8WYN3 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CSRNP3Q8WYN3 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CSRNP3Q8WYN3 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CSRNP3Q8WYN3 SFMBT2-202ENST00000379711 692 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CSRNP3Q8WYN3 AP000354.1-201ENST00000396982 456 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CSRNP3Q8WYN3 GULOP-201ENST00000454030 748 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CSRNP3Q8WYN3 CD300LF-206ENST00000464910 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CSRNP3Q8WYN3 AC022113.2-201ENST00000504935 704 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CSRNP3Q8WYN3 HNRNPA1P56-201ENST00000505767 954 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CSRNP3Q8WYN3 ORAOV1-209ENST00000538554 1000 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CSRNP3Q8WYN3 BID-209ENST00000551952 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CSRNP3Q8WYN3 AC090617.4-201ENST00000572404 422 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CSRNP3Q8WYN3 SCGB1B2P-201ENST00000595013 612 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CSRNP3Q8WYN3 AC073578.2-201ENST00000618927 464 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CSRNP3Q8WYN3 STAG3L1-204ENST00000619870 1192 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CSRNP3Q8WYN3 AC138466.4-201ENST00000623965 852 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CSRNP3Q8WYN3 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CSRNP3Q8WYN3 TUBA1B-202ENST00000336023 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CSRNP3Q8WYN3 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CSRNP3Q8WYN3 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CSRNP3Q8WYN3 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CSRNP3Q8WYN3 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CSRNP3Q8WYN3 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CSRNP3Q8WYN3 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms