Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVM0

CCDC50, Coiled-coil domain-containing protein 50, humanhuman

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC50Q8IVM0 ZDHHC8-203ENST00000405930 3112 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC50Q8IVM0 ZNF23-203ENST00000393539 3242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC50Q8IVM0 FLT4-201ENST00000261937 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC50Q8IVM0 KIAA1217-209ENST00000430453 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC50Q8IVM0 KIAA1217-211ENST00000458595 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC50Q8IVM0 ANKRD36-204ENST00000461153 6102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC50Q8IVM0 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC50Q8IVM0 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC50Q8IVM0 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC50Q8IVM0 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC50Q8IVM0 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CCDC50Q8IVM0 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CCDC50Q8IVM0 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC50Q8IVM0 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC50Q8IVM0 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC50Q8IVM0 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CCDC50Q8IVM0 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC50Q8IVM0 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC50Q8IVM0 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC50Q8IVM0 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC50Q8IVM0 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC50Q8IVM0 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CCDC50Q8IVM0 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC50Q8IVM0 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC50Q8IVM0 EFHC1-230ENST00000637263 2089 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC50Q8IVM0 SNX12-202ENST00000374274 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC50Q8IVM0 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC50Q8IVM0 NRROS-201ENST00000328557 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC50Q8IVM0 CRACR2A-203ENST00000440314 2697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC50Q8IVM0 UBE2E2-202ENST00000396703 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC50Q8IVM0 PDE2A-203ENST00000418754 2855 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC50Q8IVM0 CYB561-202ENST00000392975 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC50Q8IVM0 SNX19-211ENST00000533214 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC50Q8IVM0 SPTSSB-201ENST00000359175 3103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC50Q8IVM0 SYNE3-201ENST00000334258 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC50Q8IVM0 IGFN1-201ENST00000295591 4439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC50Q8IVM0 SON-203ENST00000381679 7860 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC50Q8IVM0 BCL2L11-221ENST00000621302 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC50Q8IVM0 BCL2L11-222ENST00000622509 5231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC50Q8IVM0 GLRX3-202ENST00000368644 3827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC50Q8IVM0 PSKH1-201ENST00000291041 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC50Q8IVM0 BEGAIN-212ENST00000637716 3259 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC50Q8IVM0 ALAD-201ENST00000409155 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC50Q8IVM0 MAP3K12-203ENST00000547035 2944 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC50Q8IVM0 CRELD1-202ENST00000383811 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC50Q8IVM0 ERAP1-201ENST00000296754 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC50Q8IVM0 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC50Q8IVM0 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC50Q8IVM0 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC50Q8IVM0 SPG11-202ENST00000427534 6935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC50Q8IVM0 MAMDC4-202ENST00000445819 3895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC50Q8IVM0 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC50Q8IVM0 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC50Q8IVM0 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC50Q8IVM0 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC50Q8IVM0 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC50Q8IVM0 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC50Q8IVM0 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC50Q8IVM0 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC50Q8IVM0 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC50Q8IVM0 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC50Q8IVM0 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC50Q8IVM0 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC50Q8IVM0 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CCDC50Q8IVM0 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC50Q8IVM0 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC50Q8IVM0 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC50Q8IVM0 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC50Q8IVM0 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CCDC50Q8IVM0 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CCDC50Q8IVM0 ATP2B2-210ENST00000638646 3465 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC50Q8IVM0 ZDHHC8-201ENST00000320602 3072 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC50Q8IVM0 FNTB-201ENST00000246166 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC50Q8IVM0 ANKS1B-208ENST00000547010 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC50Q8IVM0 SFI1-208ENST00000432498 4162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC50Q8IVM0 SLC9A3P3-201ENST00000457608 2229 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CCDC50Q8IVM0 SLC5A9-210ENST00000533824 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC50Q8IVM0 ZHX1-202ENST00000395571 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC50Q8IVM0 MTSS1-216ENST00000524090 2166 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC50Q8IVM0 RREB1-210ENST00000611109 3563 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC50Q8IVM0 NDUFA10-201ENST00000252711 4915 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC50Q8IVM0 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC50Q8IVM0 PP14571-202ENST00000404891 2017 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC50Q8IVM0 CELSR1-201ENST00000262738 11389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC50Q8IVM0 RAB40A-201ENST00000304236 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC50Q8IVM0 DDX31-202ENST00000372153 3285 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC50Q8IVM0 SRGAP3-201ENST00000360413 8415 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC50Q8IVM0 HYOU1-220ENST00000617285 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC50Q8IVM0 AFF1-201ENST00000307808 9390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC50Q8IVM0 AFF3-201ENST00000317233 8135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC50Q8IVM0 RBM44-201ENST00000316997 4282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC50Q8IVM0 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC50Q8IVM0 TNPO2-218ENST00000592287 2914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC50Q8IVM0 ATP6V0A4-202ENST00000353492 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC50Q8IVM0 CDH16-204ENST00000565796 2694 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC50Q8IVM0 CREB3L4-204ENST00000368603 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC50Q8IVM0 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC50Q8IVM0 TTC38-201ENST00000381031 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC50Q8IVM0 PRDM10-202ENST00000358825 6322 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC50Q8IVM0 PRDM10-203ENST00000360871 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms