Protein–RNA interactions for Protein: Q7LGA3

HS2ST1, Heparan sulfate 2-O-sulfotransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HS2ST1Q7LGA3 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HS2ST1Q7LGA3 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HS2ST1Q7LGA3 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HS2ST1Q7LGA3 NAP1L2-201ENST00000373517 2550 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HS2ST1Q7LGA3 ZNF541-202ENST00000314121 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HS2ST1Q7LGA3 AC005324.3-201ENST00000455584 5514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HS2ST1Q7LGA3 PLD2-201ENST00000263088 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HS2ST1Q7LGA3 TRMT1L-201ENST00000367506 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HS2ST1Q7LGA3 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HS2ST1Q7LGA3 CKMT2-203ENST00000437669 1479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HS2ST1Q7LGA3 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HS2ST1Q7LGA3 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HS2ST1Q7LGA3 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
HS2ST1Q7LGA3 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HS2ST1Q7LGA3 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HS2ST1Q7LGA3 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
HS2ST1Q7LGA3 AL139158.3-201ENST00000641212 1562 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
HS2ST1Q7LGA3 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
HS2ST1Q7LGA3 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HS2ST1Q7LGA3 ELP4-228ENST00000640954 1612 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
HS2ST1Q7LGA3 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HS2ST1Q7LGA3 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HS2ST1Q7LGA3 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HS2ST1Q7LGA3 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HS2ST1Q7LGA3 AP1B1-208ENST00000432560 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HS2ST1Q7LGA3 SLC6A5-202ENST00000525748 7084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HS2ST1Q7LGA3 NOB1-201ENST00000268802 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HS2ST1Q7LGA3 SELENOV-202ENST00000423711 1701 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HS2ST1Q7LGA3 AC072061.1-201ENST00000569710 2234 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HS2ST1Q7LGA3 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HS2ST1Q7LGA3 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HS2ST1Q7LGA3 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HS2ST1Q7LGA3 WASF3-202ENST00000361042 4823 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HS2ST1Q7LGA3 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HS2ST1Q7LGA3 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HS2ST1Q7LGA3 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HS2ST1Q7LGA3 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HS2ST1Q7LGA3 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HS2ST1Q7LGA3 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HS2ST1Q7LGA3 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HS2ST1Q7LGA3 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HS2ST1Q7LGA3 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HS2ST1Q7LGA3 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HS2ST1Q7LGA3 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HS2ST1Q7LGA3 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HS2ST1Q7LGA3 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HS2ST1Q7LGA3 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HS2ST1Q7LGA3 CHCHD2P2-201ENST00000503744 321 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HS2ST1Q7LGA3 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HS2ST1Q7LGA3 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HS2ST1Q7LGA3 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HS2ST1Q7LGA3 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HS2ST1Q7LGA3 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HS2ST1Q7LGA3 CR392039.2-201ENST00000623182 509 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HS2ST1Q7LGA3 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HS2ST1Q7LGA3 EMILIN1-201ENST00000380320 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HS2ST1Q7LGA3 ELAVL1-201ENST00000407627 6015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HS2ST1Q7LGA3 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HS2ST1Q7LGA3 CSPG4-201ENST00000308508 8290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HS2ST1Q7LGA3 CROT-203ENST00000419147 2959 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HS2ST1Q7LGA3 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HS2ST1Q7LGA3 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HS2ST1Q7LGA3 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HS2ST1Q7LGA3 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HS2ST1Q7LGA3 PDE8B-205ENST00000346042 3276 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HS2ST1Q7LGA3 AMOTL2-212ENST00000514516 4521 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HS2ST1Q7LGA3 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HS2ST1Q7LGA3 C14orf39-201ENST00000321731 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HS2ST1Q7LGA3 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HS2ST1Q7LGA3 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HS2ST1Q7LGA3 TCHH-202ENST00000614923 6995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HS2ST1Q7LGA3 ABCC10-204ENST00000372530 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HS2ST1Q7LGA3 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HS2ST1Q7LGA3 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HS2ST1Q7LGA3 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HS2ST1Q7LGA3 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HS2ST1Q7LGA3 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HS2ST1Q7LGA3 CARMIL2-202ENST00000545661 4119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HS2ST1Q7LGA3 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HS2ST1Q7LGA3 GPRASP1-203ENST00000444152 5809 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HS2ST1Q7LGA3 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HS2ST1Q7LGA3 POFUT1-202ENST00000375749 5235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HS2ST1Q7LGA3 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HS2ST1Q7LGA3 DIS3L2-205ENST00000409401 2048 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HS2ST1Q7LGA3 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HS2ST1Q7LGA3 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HS2ST1Q7LGA3 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HS2ST1Q7LGA3 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HS2ST1Q7LGA3 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HS2ST1Q7LGA3 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HS2ST1Q7LGA3 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HS2ST1Q7LGA3 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HS2ST1Q7LGA3 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HS2ST1Q7LGA3 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HS2ST1Q7LGA3 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HS2ST1Q7LGA3 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HS2ST1Q7LGA3 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HS2ST1Q7LGA3 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HS2ST1Q7LGA3 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HS2ST1Q7LGA3 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms