Protein–RNA interactions for Protein: Q5UIP0

RIF1, Telomere-associated protein RIF1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIF1Q5UIP0 AC005609.1-201ENST00000625195 617 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RIF1Q5UIP0 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
RIF1Q5UIP0 RNF14-201ENST00000347642 4213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RIF1Q5UIP0 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RIF1Q5UIP0 OR2C1-201ENST00000304936 1406 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RIF1Q5UIP0 TRO-225ENST00000622017 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RIF1Q5UIP0 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RIF1Q5UIP0 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RIF1Q5UIP0 ADCK1-201ENST00000238561 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RIF1Q5UIP0 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RIF1Q5UIP0 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RIF1Q5UIP0 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RIF1Q5UIP0 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RIF1Q5UIP0 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RIF1Q5UIP0 POLR1C-203ENST00000372389 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RIF1Q5UIP0 FAHD2A-204ENST00000447036 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RIF1Q5UIP0 MPZL3-204ENST00000527472 1381 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RIF1Q5UIP0 RUSC1-AS1-202ENST00000446880 1836 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RIF1Q5UIP0 CHCHD7-218ENST00000523975 1805 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RIF1Q5UIP0 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RIF1Q5UIP0 ZCCHC7-201ENST00000322831 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RIF1Q5UIP0 MYL1-202ENST00000352451 1065 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RIF1Q5UIP0 C9orf24-202ENST00000379124 648 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RIF1Q5UIP0 POLR3DP1-201ENST00000398689 1176 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
RIF1Q5UIP0 AC109830.1-203ENST00000506638 467 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RIF1Q5UIP0 AC008808.2-201ENST00000510349 569 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RIF1Q5UIP0 AC078925.1-201ENST00000535370 568 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RIF1Q5UIP0 RBMX-209ENST00000565438 1292 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RIF1Q5UIP0 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
RIF1Q5UIP0 PSMG3-AS1-207ENST00000612019 586 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RIF1Q5UIP0 TNFRSF10A-204ENST00000613472 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RIF1Q5UIP0 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RIF1Q5UIP0 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RIF1Q5UIP0 RDH12-203ENST00000551171 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RIF1Q5UIP0 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RIF1Q5UIP0 KRT18P45-201ENST00000515347 1333 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
RIF1Q5UIP0 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RIF1Q5UIP0 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RIF1Q5UIP0 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RIF1Q5UIP0 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RIF1Q5UIP0 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RIF1Q5UIP0 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RIF1Q5UIP0 MIR4435-2HG-201ENST00000308604 552 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RIF1Q5UIP0 SGCA-202ENST00000344627 1057 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RIF1Q5UIP0 MT-ND6-201ENST00000361681 525 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RIF1Q5UIP0 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
RIF1Q5UIP0 RANBP6-202ENST00000485372 1000 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RIF1Q5UIP0 AL512310.5-201ENST00000551999 515 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
RIF1Q5UIP0 RN7SL460P-201ENST00000582806 258 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
RIF1Q5UIP0 PDLIM2-218ENST00000614502 599 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RIF1Q5UIP0 TRPC5OS-203ENST00000635763 955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RIF1Q5UIP0 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RIF1Q5UIP0 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RIF1Q5UIP0 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RIF1Q5UIP0 NELL2-203ENST00000429094 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RIF1Q5UIP0 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RIF1Q5UIP0 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RIF1Q5UIP0 EDN1-201ENST00000379375 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RIF1Q5UIP0 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RIF1Q5UIP0 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RIF1Q5UIP0 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RIF1Q5UIP0 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RIF1Q5UIP0 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RIF1Q5UIP0 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RIF1Q5UIP0 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RIF1Q5UIP0 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RIF1Q5UIP0 AL592301.1-201ENST00000439501 864 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RIF1Q5UIP0 PGAP2-219ENST00000479072 894 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RIF1Q5UIP0 AC027290.1-201ENST00000537827 484 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RIF1Q5UIP0 TMEM241-208ENST00000542162 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RIF1Q5UIP0 GOLGA2P10-201ENST00000550961 817 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
RIF1Q5UIP0 ALG10B-203ENST00000551464 571 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RIF1Q5UIP0 AP001505.1-201ENST00000569966 824 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
RIF1Q5UIP0 AC011479.2-201ENST00000598146 432 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RIF1Q5UIP0 AC008894.2-202ENST00000599676 1027 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RIF1Q5UIP0 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RIF1Q5UIP0 CDCA7-203ENST00000410019 1488 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RIF1Q5UIP0 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RIF1Q5UIP0 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RIF1Q5UIP0 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RIF1Q5UIP0 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RIF1Q5UIP0 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RIF1Q5UIP0 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RIF1Q5UIP0 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RIF1Q5UIP0 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
RIF1Q5UIP0 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RIF1Q5UIP0 TMEM145-203ENST00000598766 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RIF1Q5UIP0 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RIF1Q5UIP0 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RIF1Q5UIP0 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RIF1Q5UIP0 TIMM10-201ENST00000257245 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RIF1Q5UIP0 TPT1-201ENST00000309246 1008 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RIF1Q5UIP0 LY6G6F-201ENST00000375832 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RIF1Q5UIP0 IGLJ1-201ENST00000390320 127 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RIF1Q5UIP0 AC017081.1-201ENST00000420063 823 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
RIF1Q5UIP0 AL662899.2-201ENST00000503322 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RIF1Q5UIP0 MNAT1-202ENST00000539616 1220 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RIF1Q5UIP0 AL139099.3-201ENST00000556657 401 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RIF1Q5UIP0 AL390726.3-201ENST00000567428 635 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RIF1Q5UIP0 MED11-203ENST00000575284 652 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms