Protein–RNA interactions for Protein: Q3B7T1

EDRF1, Erythroid differentiation-related factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDRF1Q3B7T1 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 RERG-201ENST00000256953 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 ADAMTS10-201ENST00000270328 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 SPDYA-202ENST00000379579 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 SNCA-204ENST00000394989 3167 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 KIF3C-202ENST00000405914 3180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 APOD-201ENST00000343267 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 OPN1MW2-201ENST00000369929 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 SLC25A15P3-201ENST00000505530 290 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 NDUFB10P1-201ENST00000567319 521 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 AC093899.2-201ENST00000513963 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 NLRX1-201ENST00000292199 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 PLEKHG6-201ENST00000011684 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 MAP7D2-204ENST00000452324 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 AC006450.3-201ENST00000453529 2146 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 SLC20A2-207ENST00000520179 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 L3MBTL1-204ENST00000418998 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 DCAF8L2-203ENST00000545306 2013 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 HMGCL-203ENST00000374490 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 KCNIP1-210ENST00000636734 1613 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 FAM122B-201ENST00000298090 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 LILRB2-202ENST00000391746 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 RPL18A-205ENST00000600147 1391 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 SYBU-217ENST00000528331 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 LHFPL1-201ENST00000371968 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 SLC25A31-201ENST00000281154 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 MT1H-201ENST00000332374 397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 FAM122C-203ENST00000414371 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 PSMB8-AS1-204ENST00000429600 996 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 SLC4A8-205ENST00000535225 2262 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 BFAR-203ENST00000562442 1414 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 SLC47A1-206ENST00000571335 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 CLOCK-211ENST00000513440 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 CSF2RB-203ENST00000406230 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 LINC01341-202ENST00000421003 2600 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 LILRA2-203ENST00000391737 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 KRT8P43-201ENST00000406052 1458 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 Z98885.3-201ENST00000624882 1757 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 IFT172-202ENST00000359466 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 PPP1R13L-201ENST00000360957 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 HS3ST5-201ENST00000312719 3901 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 ANKMY1-208ENST00000405002 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 AL355102.3-201ENST00000554299 1678 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 PPP2R1B-204ENST00000426998 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms