Protein–RNA interactions for Protein: Q2VYF4

LETM2, LETM1 domain-containing protein LETM2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETM2Q2VYF4 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LETM2Q2VYF4 PCDHGA11-201ENST00000398587 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LETM2Q2VYF4 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LETM2Q2VYF4 GMCL1-201ENST00000282570 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LETM2Q2VYF4 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LETM2Q2VYF4 EMILIN1-201ENST00000380320 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LETM2Q2VYF4 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LETM2Q2VYF4 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LETM2Q2VYF4 DUT-208ENST00000559540 1441 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LETM2Q2VYF4 BFAR-203ENST00000562442 1414 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LETM2Q2VYF4 TNNI1-201ENST00000336092 1750 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LETM2Q2VYF4 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LETM2Q2VYF4 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LETM2Q2VYF4 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LETM2Q2VYF4 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LETM2Q2VYF4 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LETM2Q2VYF4 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LETM2Q2VYF4 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LETM2Q2VYF4 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
LETM2Q2VYF4 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LETM2Q2VYF4 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LETM2Q2VYF4 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LETM2Q2VYF4 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LETM2Q2VYF4 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LETM2Q2VYF4 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LETM2Q2VYF4 LINC00887-204ENST00000456816 796 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LETM2Q2VYF4 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
LETM2Q2VYF4 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LETM2Q2VYF4 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
LETM2Q2VYF4 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LETM2Q2VYF4 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
LETM2Q2VYF4 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LETM2Q2VYF4 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
LETM2Q2VYF4 AC005498.2-204ENST00000590613 413 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LETM2Q2VYF4 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
LETM2Q2VYF4 AL021707.6-201ENST00000609212 491 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
LETM2Q2VYF4 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
LETM2Q2VYF4 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
LETM2Q2VYF4 TP53-221ENST00000615910 1149 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LETM2Q2VYF4 SMOC2-202ENST00000356284 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LETM2Q2VYF4 ENDOV-207ENST00000518907 2418 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LETM2Q2VYF4 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LETM2Q2VYF4 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LETM2Q2VYF4 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LETM2Q2VYF4 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LETM2Q2VYF4 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LETM2Q2VYF4 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LETM2Q2VYF4 IFITM10-201ENST00000340134 3706 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LETM2Q2VYF4 KIAA0895-203ENST00000338533 4132 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LETM2Q2VYF4 FMNL3-205ENST00000550488 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LETM2Q2VYF4 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LETM2Q2VYF4 NR4A1-202ENST00000360284 2589 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LETM2Q2VYF4 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LETM2Q2VYF4 AC072061.1-201ENST00000569710 2234 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
LETM2Q2VYF4 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LETM2Q2VYF4 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LETM2Q2VYF4 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LETM2Q2VYF4 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LETM2Q2VYF4 ERLIN1-202ENST00000407654 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LETM2Q2VYF4 AC061965.1-201ENST00000560524 1465 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
LETM2Q2VYF4 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LETM2Q2VYF4 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LETM2Q2VYF4 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LETM2Q2VYF4 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LETM2Q2VYF4 ARMCX3-203ENST00000471229 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LETM2Q2VYF4 CAND2-201ENST00000295989 4429 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LETM2Q2VYF4 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LETM2Q2VYF4 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LETM2Q2VYF4 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LETM2Q2VYF4 PCTP-207ENST00000576183 2680 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LETM2Q2VYF4 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LETM2Q2VYF4 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LETM2Q2VYF4 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LETM2Q2VYF4 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LETM2Q2VYF4 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LETM2Q2VYF4 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LETM2Q2VYF4 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LETM2Q2VYF4 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LETM2Q2VYF4 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LETM2Q2VYF4 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LETM2Q2VYF4 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LETM2Q2VYF4 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LETM2Q2VYF4 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LETM2Q2VYF4 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
LETM2Q2VYF4 RN7SL455P-201ENST00000580629 282 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
LETM2Q2VYF4 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LETM2Q2VYF4 SNHG25-202ENST00000582965 278 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LETM2Q2VYF4 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
LETM2Q2VYF4 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
LETM2Q2VYF4 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LETM2Q2VYF4 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LETM2Q2VYF4 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LETM2Q2VYF4 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LETM2Q2VYF4 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LETM2Q2VYF4 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LETM2Q2VYF4 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
LETM2Q2VYF4 CDH16-201ENST00000299752 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LETM2Q2VYF4 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LETM2Q2VYF4 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LETM2Q2VYF4 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
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