Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 KLK4-201ENST00000324041 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 C7orf49-214ENST00000620897 1349 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 POLR2G-201ENST00000301788 827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 OLFML2B-202ENST00000367938 1153 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 SSR4-202ENST00000370085 526 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 TCEA3-201ENST00000374601 1197 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 CST9-201ENST00000376971 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 RPS9-202ENST00000391751 510 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 Z82188.2-201ENST00000419128 630 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 FAM3D-AS1-201ENST00000464125 821 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 AC099548.2-201ENST00000491047 571 ntTSL 4 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 AC008443.1-202ENST00000506340 687 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 AC145422.1-201ENST00000541574 544 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 LPCAT4-209ENST00000617710 1719 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 DEDD-202ENST00000368006 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 TMEM56-RWDD3-202ENST00000604534 1491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 PRMT2-216ENST00000621201 1301 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 NUDT2-201ENST00000346365 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 TNNT2-207ENST00000367322 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 NUDT2-202ENST00000379155 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 VPREB1-202ENST00000403807 755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 OR2W2P-201ENST00000406313 909 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 SEPT7-AS1-201ENST00000412856 587 ntTSL 4 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 GS1-124K5.4-201ENST00000445681 540 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 AL451069.3-201ENST00000450206 1013 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 GPX3-202ENST00000517973 612 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 VEGFA-219ENST00000518824 606 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 KHDRBS3-206ENST00000520981 1243 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 IKBKB-223ENST00000522147 954 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 AP003351.1-201ENST00000522743 668 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 C12orf57-204ENST00000540506 551 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 GABARAPL1-213ENST00000544284 531 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 SRP14-208ENST00000560773 468 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 AC115099.1-201ENST00000570413 362 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 AC023389.1-201ENST00000577846 576 ntTSL 4 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 RN7SL602P-201ENST00000578326 324 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 AC132825.4-202ENST00000578792 434 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 CEP95-212ENST00000581056 903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 RN7SL718P-201ENST00000581254 303 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 AC005777.1-201ENST00000588332 187 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 FAAP24-203ENST00000589646 836 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 NUDT2-204ENST00000618590 825 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 ZNF691-201ENST00000372502 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 MSRA-201ENST00000317173 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 ALG3-205ENST00000445626 1533 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
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