Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 ADSL-201ENST00000216194 1620 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 MS4A15-201ENST00000337911 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 HTR3E-203ENST00000425359 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 LINC00470-210ENST00000584090 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 UQCC2-204ENST00000607484 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 PPM1N-201ENST00000396735 895 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 RBM14-204ENST00000409738 372 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 ACTG2-204ENST00000409918 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 NUPL2-202ENST00000410002 680 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 AL135901.1-201ENST00000451812 333 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 PPM1N-208ENST00000456399 618 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 FAM86B3P-203ENST00000523992 854 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 PMFBP1-208ENST00000537792 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 AC145285.5-201ENST00000562217 361 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 AC003043.1-201ENST00000588260 337 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 AP005131.2-201ENST00000589045 487 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 PGPEP1-203ENST00000595066 762 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 CSAG3-203ENST00000638835 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 CSAG2-204ENST00000640702 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 CMTM1-201ENST00000328020 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 CMTM1-202ENST00000332695 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 CSAG1-203ENST00000370291 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 MAGOH-202ENST00000371470 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 CMTM1-205ENST00000379500 1064 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 LINC00265-2P-201ENST00000413372 782 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 AC006329.1-201ENST00000419422 705 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 ACYP2-204ENST00000422521 1115 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms