Protein–RNA interactions for Protein: P23327

HRC, Sarcoplasmic reticulum histidine-rich calcium-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HRCP23327 AMDHD2-202ENST00000302956 3273 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HRCP23327 NRP1-202ENST00000374816 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HRCP23327 ACTN1-205ENST00000538545 2813 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HRCP23327 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HRCP23327 HYOU1-219ENST00000614711 3057 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HRCP23327 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HRCP23327 LINC01301-202ENST00000506428 2444 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HRCP23327 RNF214-201ENST00000300650 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HRCP23327 DNAJC14-202ENST00000317287 2774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HRCP23327 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HRCP23327 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HRCP23327 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HRCP23327 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HRCP23327 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HRCP23327 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HRCP23327 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HRCP23327 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
HRCP23327 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HRCP23327 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HRCP23327 AL117190.1-201ENST00000637474 1985 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HRCP23327 CPN2-201ENST00000323830 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HRCP23327 TRPC7-201ENST00000352189 2241 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HRCP23327 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
HRCP23327 GFRA2-202ENST00000517328 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HRCP23327 ATG14-201ENST00000247178 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HRCP23327 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HRCP23327 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HRCP23327 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HRCP23327 PIP5K1A-204ENST00000409426 3737 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HRCP23327 AL031714.1-202ENST00000568106 3107 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HRCP23327 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HRCP23327 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HRCP23327 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HRCP23327 METAP1-201ENST00000296411 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HRCP23327 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HRCP23327 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HRCP23327 ZBTB42-201ENST00000342537 3800 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HRCP23327 CYP2J2-201ENST00000371204 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HRCP23327 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
HRCP23327 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HRCP23327 NCDN-201ENST00000356090 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HRCP23327 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HRCP23327 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HRCP23327 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HRCP23327 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
HRCP23327 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
HRCP23327 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HRCP23327 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HRCP23327 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HRCP23327 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HRCP23327 AC008050.1-201ENST00000554926 632 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HRCP23327 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
HRCP23327 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
HRCP23327 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
HRCP23327 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HRCP23327 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
HRCP23327 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
HRCP23327 LINC01726-201ENST00000624692 1253 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HRCP23327 DRD2-208ENST00000542968 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HRCP23327 NDRG4-236ENST00000566192 3265 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HRCP23327 WTH3DI-201ENST00000623617 3032 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HRCP23327 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HRCP23327 AGAP2-203ENST00000547588 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HRCP23327 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HRCP23327 TRGV9-201ENST00000444775 1735 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HRCP23327 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HRCP23327 RC3H2-201ENST00000335387 3081 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HRCP23327 CHEK2-201ENST00000328354 1867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HRCP23327 SFI1-208ENST00000432498 4162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HRCP23327 AGAP5-202ENST00000443782 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HRCP23327 AGAP4-203ENST00000448048 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HRCP23327 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HRCP23327 SUPV3L1-201ENST00000359655 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HRCP23327 KLC2-206ENST00000417856 3015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HRCP23327 FAM90A26-201ENST00000512047 2492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HRCP23327 ADAMTSL2-203ENST00000393061 4270 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HRCP23327 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
HRCP23327 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HRCP23327 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
HRCP23327 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HRCP23327 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HRCP23327 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HRCP23327 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
HRCP23327 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HRCP23327 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HRCP23327 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HRCP23327 ITGA3-201ENST00000007722 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HRCP23327 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HRCP23327 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
HRCP23327 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
HRCP23327 GPR107-208ENST00000610997 2813 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
HRCP23327 MSH6-214ENST00000616033 3429 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
HRCP23327 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.11
HRCP23327 PPT1-203ENST00000433473 2267 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HRCP23327 HTR3A-201ENST00000299961 1994 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HRCP23327 GOLGA8EP-201ENST00000530246 1959 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
HRCP23327 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HRCP23327 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HRCP23327 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
HRCP23327 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms