Protein–RNA interactions for Protein: P0DME0

SETSIP, Protein SETSIP, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETSIPP0DME0 SMARCA5-201ENST00000283131 7923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SETSIPP0DME0 TRIB1-201ENST00000311922 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SETSIPP0DME0 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SETSIPP0DME0 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SETSIPP0DME0 UMODL1-204ENST00000400427 5442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SETSIPP0DME0 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SETSIPP0DME0 CEMIP-202ENST00000356249 7297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SETSIPP0DME0 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SETSIPP0DME0 LIG1-203ENST00000536218 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SETSIPP0DME0 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SETSIPP0DME0 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SETSIPP0DME0 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SETSIPP0DME0 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SETSIPP0DME0 SOAT1-204ENST00000540564 6861 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SETSIPP0DME0 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SETSIPP0DME0 ZIK1-204ENST00000597850 4181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SETSIPP0DME0 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SETSIPP0DME0 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SETSIPP0DME0 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SETSIPP0DME0 COL22A1-201ENST00000303045 6346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SETSIPP0DME0 CD22-209ENST00000594250 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SETSIPP0DME0 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SETSIPP0DME0 RPL13AP3-202ENST00000494676 1473 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
SETSIPP0DME0 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SETSIPP0DME0 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SETSIPP0DME0 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SETSIPP0DME0 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SETSIPP0DME0 SLC4A5-201ENST00000346834 6233 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SETSIPP0DME0 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SETSIPP0DME0 FAM96A-203ENST00000557835 1536 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SETSIPP0DME0 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SETSIPP0DME0 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SETSIPP0DME0 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SETSIPP0DME0 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SETSIPP0DME0 VAMP4-201ENST00000236192 5159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SETSIPP0DME0 NRP2-201ENST00000272849 5909 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SETSIPP0DME0 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SETSIPP0DME0 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SETSIPP0DME0 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SETSIPP0DME0 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SETSIPP0DME0 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SETSIPP0DME0 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SETSIPP0DME0 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SETSIPP0DME0 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SETSIPP0DME0 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
SETSIPP0DME0 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SETSIPP0DME0 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SETSIPP0DME0 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SETSIPP0DME0 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SETSIPP0DME0 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SETSIPP0DME0 STK3-201ENST00000419617 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SETSIPP0DME0 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SETSIPP0DME0 OR2A25-202ENST00000641441 1733 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
SETSIPP0DME0 OTP-201ENST00000306422 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SETSIPP0DME0 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SETSIPP0DME0 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SETSIPP0DME0 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SETSIPP0DME0 USP39-220ENST00000613444 2161 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SETSIPP0DME0 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SETSIPP0DME0 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SETSIPP0DME0 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SETSIPP0DME0 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SETSIPP0DME0 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SETSIPP0DME0 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SETSIPP0DME0 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SETSIPP0DME0 DSE-201ENST00000331677 7237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SETSIPP0DME0 ITPR3-202ENST00000605930 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SETSIPP0DME0 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SETSIPP0DME0 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SETSIPP0DME0 USP39-207ENST00000450066 2086 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SETSIPP0DME0 FLNC-202ENST00000346177 9042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SETSIPP0DME0 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SETSIPP0DME0 CLTCL1-212ENST00000622493 1714 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SETSIPP0DME0 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SETSIPP0DME0 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SETSIPP0DME0 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SETSIPP0DME0 LINC02048-201ENST00000440556 1771 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SETSIPP0DME0 TACC3-212ENST00000612220 1756 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SETSIPP0DME0 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SETSIPP0DME0 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SETSIPP0DME0 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SETSIPP0DME0 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SETSIPP0DME0 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SETSIPP0DME0 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SETSIPP0DME0 GOLGA2P8-201ENST00000505201 779 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SETSIPP0DME0 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SETSIPP0DME0 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SETSIPP0DME0 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SETSIPP0DME0 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SETSIPP0DME0 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SETSIPP0DME0 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SETSIPP0DME0 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SETSIPP0DME0 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SETSIPP0DME0 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SETSIPP0DME0 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SETSIPP0DME0 PSD-202ENST00000406432 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SETSIPP0DME0 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SETSIPP0DME0 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SETSIPP0DME0 MFSD11-217ENST00000590514 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SETSIPP0DME0 CNTN2-201ENST00000331830 7999 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.9 ms