Protein–RNA interactions for Protein: O14908

GIPC1, PDZ domain-containing protein GIPC1, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC1O14908 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GIPC1O14908 NR3C1-201ENST00000231509 3556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GIPC1O14908 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GIPC1O14908 RNF216-205ENST00000425013 5639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GIPC1O14908 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GIPC1O14908 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GIPC1O14908 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GIPC1O14908 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GIPC1O14908 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GIPC1O14908 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GIPC1O14908 ABCB8-202ENST00000358849 4683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GIPC1O14908 AC002407.1-201ENST00000636668 3863 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GIPC1O14908 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.07
GIPC1O14908 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.07
GIPC1O14908 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GIPC1O14908 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GIPC1O14908 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GIPC1O14908 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GIPC1O14908 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GIPC1O14908 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GIPC1O14908 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
GIPC1O14908 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GIPC1O14908 SNED1-205ENST00000405547 7986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GIPC1O14908 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GIPC1O14908 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GIPC1O14908 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GIPC1O14908 ZNF717-204ENST00000478296 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GIPC1O14908 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GIPC1O14908 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GIPC1O14908 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GIPC1O14908 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GIPC1O14908 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GIPC1O14908 MADD-203ENST00000349238 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GIPC1O14908 PRPF38A-201ENST00000257181 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GIPC1O14908 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GIPC1O14908 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GIPC1O14908 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GIPC1O14908 SETD7-203ENST00000406354 1127 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GIPC1O14908 AC004973.1-201ENST00000413240 635 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GIPC1O14908 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GIPC1O14908 TCERG1L-AS1-201ENST00000436942 472 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GIPC1O14908 AL157792.1-201ENST00000488281 530 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
GIPC1O14908 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
GIPC1O14908 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GIPC1O14908 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
GIPC1O14908 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
GIPC1O14908 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
GIPC1O14908 RPL19-207ENST00000582193 792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GIPC1O14908 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GIPC1O14908 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
GIPC1O14908 CIITA-213ENST00000618327 4657 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GIPC1O14908 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
GIPC1O14908 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GIPC1O14908 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GIPC1O14908 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GIPC1O14908 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GIPC1O14908 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GIPC1O14908 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GIPC1O14908 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GIPC1O14908 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GIPC1O14908 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GIPC1O14908 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GIPC1O14908 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GIPC1O14908 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GIPC1O14908 MAEA-207ENST00000505177 1340 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GIPC1O14908 ENTPD4-202ENST00000358689 5861 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GIPC1O14908 IKZF1-203ENST00000346667 5376 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GIPC1O14908 DLGAP1-201ENST00000315677 6683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GIPC1O14908 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GIPC1O14908 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GIPC1O14908 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GIPC1O14908 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GIPC1O14908 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GIPC1O14908 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GIPC1O14908 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
GIPC1O14908 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GIPC1O14908 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
GIPC1O14908 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GIPC1O14908 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GIPC1O14908 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GIPC1O14908 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GIPC1O14908 SLC44A3-209ENST00000532427 1912 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GIPC1O14908 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
GIPC1O14908 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
GIPC1O14908 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GIPC1O14908 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GIPC1O14908 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GIPC1O14908 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GIPC1O14908 AC012362.1-201ENST00000434906 739 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
GIPC1O14908 AL096772.1-201ENST00000451135 781 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GIPC1O14908 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GIPC1O14908 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GIPC1O14908 IGHV3-37-201ENST00000518544 340 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
GIPC1O14908 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GIPC1O14908 FXYD2-205ENST00000528014 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GIPC1O14908 FOS-204ENST00000554617 796 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GIPC1O14908 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GIPC1O14908 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GIPC1O14908 BX547991.1-201ENST00000582543 1206 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GIPC1O14908 MIR4649-201ENST00000582839 64 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
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