Protein–RNA interactions for Protein: B2RUZ4

SMIM1, Small integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM1B2RUZ4 SH2D3C-201ENST00000314830 3124 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 LAIR1-201ENST00000348231 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 C15orf39-202ENST00000394987 4430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 AC092171.2-201ENST00000444210 3251 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 UNC13B-202ENST00000378496 5063 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 MAP7D2-202ENST00000379651 3930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 DMAC1-201ENST00000358227 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 HNRNPUL1-207ENST00000595018 2794 ntTSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 XRCC6-202ENST00000360079 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 PEX1-201ENST00000248633 4385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 COG1-201ENST00000299886 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 RASA4-203ENST00000461209 3244 ntTSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 ZFAND3-201ENST00000287218 3366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 H3F3B-201ENST00000254810 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 SAP30BP-225ENST00000584667 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 NHEJ1-201ENST00000356853 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 BRD1-201ENST00000216267 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC9.61□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC9.61□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC9.61□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC9.61□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC9.61□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC9.61□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 ACTN1-204ENST00000438964 3043 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 SLC37A4-202ENST00000357590 2356 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 USP19-202ENST00000398888 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 NRP1-202ENST00000374816 2804 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 ACTR3-201ENST00000263238 6718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 SARS-201ENST00000234677 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 C16orf62-215ENST00000542263 3138 ntTSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 AC237221.1-201ENST00000561575 1881 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 GUCY1B3-204ENST00000505154 2316 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 NEU3-204ENST00000531509 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 DAXX-213ENST00000620164 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 DCAF13-209ENST00000616836 2639 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 PCDHGA3-201ENST00000253812 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 BCAP29-201ENST00000005259 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 POTEB3-201ENST00000611217 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 CYTH1-215ENST00000591455 3286 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 ENOX1-201ENST00000261488 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 VILL-201ENST00000283713 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 FLAD1-207ENST00000368433 2656 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 LINC00638-201ENST00000555578 2518 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 NT5DC4-201ENST00000327581 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 PRDM10-202ENST00000358825 6322 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 PRDM10-203ENST00000360871 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 OPRL1-202ENST00000349451 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 MTSS1-201ENST00000325064 2777 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 COL1A2-213ENST00000620463 4523 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 SYBU-217ENST00000528331 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 CNP-202ENST00000393892 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 MPLKIP-201ENST00000306984 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 DRG2-202ENST00000395726 1897 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 NOL9-201ENST00000377705 6649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 TRAF3-208ENST00000560371 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 KCNMA1-210ENST00000404771 4014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 DPAGT1-217ENST00000639704 1719 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 TBX3-202ENST00000349155 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 DRD3-203ENST00000460779 1557 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 KRT17P4-205ENST00000579946 2555 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 BDKRB2-202ENST00000542454 6845 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 APOD-201ENST00000343267 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 EIF4G1-207ENST00000411531 4683 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms