Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT6

POLK, DNA polymerase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLKQ9UBT6 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
POLKQ9UBT6 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
POLKQ9UBT6 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
POLKQ9UBT6 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
POLKQ9UBT6 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
POLKQ9UBT6 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
POLKQ9UBT6 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
POLKQ9UBT6 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
POLKQ9UBT6 CTSV-201ENST00000259470 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
POLKQ9UBT6 AADAT-206ENST00000509167 2113 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
POLKQ9UBT6 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
POLKQ9UBT6 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
POLKQ9UBT6 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
POLKQ9UBT6 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
POLKQ9UBT6 LINC01535-206ENST00000592712 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
POLKQ9UBT6 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
POLKQ9UBT6 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
POLKQ9UBT6 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
POLKQ9UBT6 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
POLKQ9UBT6 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
POLKQ9UBT6 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
POLKQ9UBT6 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
POLKQ9UBT6 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
POLKQ9UBT6 RNF123-203ENST00000433785 1555 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
POLKQ9UBT6 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
POLKQ9UBT6 C19orf33-201ENST00000301246 467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
POLKQ9UBT6 NUDT2-201ENST00000346365 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
POLKQ9UBT6 NUDT2-202ENST00000379155 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
POLKQ9UBT6 AL137026.2-201ENST00000437014 841 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
POLKQ9UBT6 BX322557.2-201ENST00000445242 379 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
POLKQ9UBT6 MRAS-205ENST00000474559 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
POLKQ9UBT6 AC091564.6-201ENST00000526633 487 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
POLKQ9UBT6 CD44-224ENST00000526669 870 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
POLKQ9UBT6 GOLGA2P7-209ENST00000560408 745 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
POLKQ9UBT6 AC011479.1-202ENST00000591889 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
POLKQ9UBT6 TUBB6-214ENST00000592683 481 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
POLKQ9UBT6 AP000356.3-203ENST00000614808 601 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
POLKQ9UBT6 NUDT2-204ENST00000618590 825 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
POLKQ9UBT6 AC126755.5-201ENST00000622756 267 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
POLKQ9UBT6 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
POLKQ9UBT6 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
POLKQ9UBT6 RBFOX3-203ENST00000580155 1519 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
POLKQ9UBT6 AC005906.2-205ENST00000640862 1522 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
POLKQ9UBT6 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
POLKQ9UBT6 NEK3-210ENST00000620675 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
POLKQ9UBT6 TUBB8-206ENST00000568584 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
POLKQ9UBT6 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
POLKQ9UBT6 RCC2P5-201ENST00000492126 1487 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
POLKQ9UBT6 EFHD1-207ENST00000611312 1490 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
POLKQ9UBT6 CATSPERD-202ENST00000381624 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
POLKQ9UBT6 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
POLKQ9UBT6 AC092115.1-201ENST00000566277 1402 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
POLKQ9UBT6 AC040160.2-201ENST00000623816 1675 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
POLKQ9UBT6 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
POLKQ9UBT6 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
POLKQ9UBT6 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
POLKQ9UBT6 CWC27-201ENST00000381070 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
POLKQ9UBT6 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
POLKQ9UBT6 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
POLKQ9UBT6 MC5R-201ENST00000324750 1319 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
POLKQ9UBT6 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
POLKQ9UBT6 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
POLKQ9UBT6 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
POLKQ9UBT6 YWHAE-201ENST00000264335 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
POLKQ9UBT6 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
POLKQ9UBT6 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
POLKQ9UBT6 MAL-204ENST00000354078 831 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
POLKQ9UBT6 HMGCLL1-203ENST00000370850 1171 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
POLKQ9UBT6 IFNLR1-203ENST00000374418 674 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
POLKQ9UBT6 MPP6-202ENST00000396475 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
POLKQ9UBT6 ABCD1P4-201ENST00000399687 604 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
POLKQ9UBT6 AC093673.1-201ENST00000429630 648 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
POLKQ9UBT6 LRRC75A-AS1-213ENST00000484836 821 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
POLKQ9UBT6 IMMP1L-202ENST00000526776 469 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
POLKQ9UBT6 ORMDL2-205ENST00000552672 760 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
POLKQ9UBT6 AL359219.1-201ENST00000556311 934 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
POLKQ9UBT6 AC055811.3-201ENST00000584952 686 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
POLKQ9UBT6 AP005131.2-201ENST00000589045 487 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
POLKQ9UBT6 ANKRD36C-208ENST00000619511 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
POLKQ9UBT6 FO393412.1-201ENST00000619841 382 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
POLKQ9UBT6 MIR6746-201ENST00000620971 63 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
POLKQ9UBT6 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
POLKQ9UBT6 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
POLKQ9UBT6 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
POLKQ9UBT6 SALL4P6-201ENST00000429385 1691 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
POLKQ9UBT6 YIPF1-201ENST00000072644 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
POLKQ9UBT6 ALDOA-202ENST00000395240 1447 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
POLKQ9UBT6 Z84468.1-201ENST00000626321 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
POLKQ9UBT6 HMOX2-201ENST00000219700 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
POLKQ9UBT6 LIMS2-206ENST00000409754 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
POLKQ9UBT6 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
POLKQ9UBT6 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
POLKQ9UBT6 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
POLKQ9UBT6 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
POLKQ9UBT6 SFXN4-201ENST00000355697 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
POLKQ9UBT6 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
POLKQ9UBT6 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
POLKQ9UBT6 RCBTB2-205ENST00000544492 2622 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
POLKQ9UBT6 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
POLKQ9UBT6 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.4 ms