Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBK2

PPARGC1A, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGC1AQ9UBK2 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PPARGC1AQ9UBK2 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PPARGC1AQ9UBK2 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PPARGC1AQ9UBK2 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PPARGC1AQ9UBK2 GMCL1-201ENST00000282570 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PPARGC1AQ9UBK2 UMODL1-204ENST00000400427 5442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PPARGC1AQ9UBK2 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PPARGC1AQ9UBK2 RAPGEF3-205ENST00000449771 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PPARGC1AQ9UBK2 EPHA5-204ENST00000511294 5176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PPARGC1AQ9UBK2 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PPARGC1AQ9UBK2 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PPARGC1AQ9UBK2 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PPARGC1AQ9UBK2 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PPARGC1AQ9UBK2 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PPARGC1AQ9UBK2 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PPARGC1AQ9UBK2 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PPARGC1AQ9UBK2 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PPARGC1AQ9UBK2 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PPARGC1AQ9UBK2 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PPARGC1AQ9UBK2 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
PPARGC1AQ9UBK2 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PPARGC1AQ9UBK2 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
PPARGC1AQ9UBK2 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
PPARGC1AQ9UBK2 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PPARGC1AQ9UBK2 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PPARGC1AQ9UBK2 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PPARGC1AQ9UBK2 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PPARGC1AQ9UBK2 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PPARGC1AQ9UBK2 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PPARGC1AQ9UBK2 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PPARGC1AQ9UBK2 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PPARGC1AQ9UBK2 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PPARGC1AQ9UBK2 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PPARGC1AQ9UBK2 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PPARGC1AQ9UBK2 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PPARGC1AQ9UBK2 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PPARGC1AQ9UBK2 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PPARGC1AQ9UBK2 FLI1-201ENST00000281428 4151 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PPARGC1AQ9UBK2 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PPARGC1AQ9UBK2 ARHGAP10-201ENST00000336498 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PPARGC1AQ9UBK2 SPECC1L-ADORA2A-201ENST00000358654 6204 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PPARGC1AQ9UBK2 FXR1-214ENST00000480918 1996 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PPARGC1AQ9UBK2 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF541-202ENST00000314121 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PPARGC1AQ9UBK2 SATB2-211ENST00000614512 4972 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PPARGC1AQ9UBK2 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
PPARGC1AQ9UBK2 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
PPARGC1AQ9UBK2 AC027612.1-201ENST00000445234 2395 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
PPARGC1AQ9UBK2 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PPARGC1AQ9UBK2 RAPH1-213ENST00000630330 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PPARGC1AQ9UBK2 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PPARGC1AQ9UBK2 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PPARGC1AQ9UBK2 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PPARGC1AQ9UBK2 PELP1-202ENST00000436683 3524 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PPARGC1AQ9UBK2 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PPARGC1AQ9UBK2 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PPARGC1AQ9UBK2 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PPARGC1AQ9UBK2 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PPARGC1AQ9UBK2 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PPARGC1AQ9UBK2 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PPARGC1AQ9UBK2 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PPARGC1AQ9UBK2 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PPARGC1AQ9UBK2 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PPARGC1AQ9UBK2 DCUN1D4-201ENST00000334635 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PPARGC1AQ9UBK2 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PPARGC1AQ9UBK2 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PPARGC1AQ9UBK2 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PPARGC1AQ9UBK2 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PPARGC1AQ9UBK2 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PPARGC1AQ9UBK2 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PPARGC1AQ9UBK2 PCDHB3-201ENST00000231130 3355 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PPARGC1AQ9UBK2 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PPARGC1AQ9UBK2 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PPARGC1AQ9UBK2 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PPARGC1AQ9UBK2 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PPARGC1AQ9UBK2 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PPARGC1AQ9UBK2 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PPARGC1AQ9UBK2 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PPARGC1AQ9UBK2 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PPARGC1AQ9UBK2 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
PPARGC1AQ9UBK2 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PPARGC1AQ9UBK2 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PPARGC1AQ9UBK2 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PPARGC1AQ9UBK2 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PPARGC1AQ9UBK2 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PPARGC1AQ9UBK2 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PPARGC1AQ9UBK2 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PPARGC1AQ9UBK2 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PPARGC1AQ9UBK2 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PPARGC1AQ9UBK2 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PPARGC1AQ9UBK2 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PPARGC1AQ9UBK2 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PPARGC1AQ9UBK2 KIFC3-202ENST00000421376 3128 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PPARGC1AQ9UBK2 IL13RA1-202ENST00000371666 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PPARGC1AQ9UBK2 ARHGEF33-202ENST00000409978 4484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PPARGC1AQ9UBK2 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PPARGC1AQ9UBK2 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PPARGC1AQ9UBK2 PRRT3-203ENST00000412055 3761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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