Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB9

TFIP11, Tuftelin-interacting protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFIP11Q9UBB9 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TFIP11Q9UBB9 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TFIP11Q9UBB9 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TFIP11Q9UBB9 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TFIP11Q9UBB9 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TFIP11Q9UBB9 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TFIP11Q9UBB9 AL391647.1-201ENST00000395664 511 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TFIP11Q9UBB9 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TFIP11Q9UBB9 SSR1P1-201ENST00000407630 814 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TFIP11Q9UBB9 HCG24-202ENST00000414398 717 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TFIP11Q9UBB9 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TFIP11Q9UBB9 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TFIP11Q9UBB9 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TFIP11Q9UBB9 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TFIP11Q9UBB9 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TFIP11Q9UBB9 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TFIP11Q9UBB9 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TFIP11Q9UBB9 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TFIP11Q9UBB9 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TFIP11Q9UBB9 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TFIP11Q9UBB9 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TFIP11Q9UBB9 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TFIP11Q9UBB9 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TFIP11Q9UBB9 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TFIP11Q9UBB9 PEG10-205ENST00000612748 2585 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TFIP11Q9UBB9 HMGCL-203ENST00000374490 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TFIP11Q9UBB9 PIAS1-202ENST00000545237 2932 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TFIP11Q9UBB9 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TFIP11Q9UBB9 RGS9-210ENST00000635833 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TFIP11Q9UBB9 GSE1-203ENST00000405402 4366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TFIP11Q9UBB9 TRIM4-203ENST00000355947 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TFIP11Q9UBB9 USF1-202ENST00000368020 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TFIP11Q9UBB9 OCRL-202ENST00000371113 5162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TFIP11Q9UBB9 RBFADN-204ENST00000568911 5187 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TFIP11Q9UBB9 TRAF3IP3-204ENST00000367026 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TFIP11Q9UBB9 LRSAM1-201ENST00000300417 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TFIP11Q9UBB9 NAPB-202ENST00000398425 3824 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TFIP11Q9UBB9 PTPRH-202ENST00000376350 3877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TFIP11Q9UBB9 AP3M2-202ENST00000396926 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TFIP11Q9UBB9 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TFIP11Q9UBB9 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TFIP11Q9UBB9 C8orf31-201ENST00000395172 1875 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TFIP11Q9UBB9 ENG-202ENST00000373203 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TFIP11Q9UBB9 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TFIP11Q9UBB9 MYOM3-201ENST00000338909 2693 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TFIP11Q9UBB9 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TFIP11Q9UBB9 CHIT1-201ENST00000255427 1598 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TFIP11Q9UBB9 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TFIP11Q9UBB9 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TFIP11Q9UBB9 STRA6-203ENST00000416286 2750 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TFIP11Q9UBB9 AC144450.1-201ENST00000366424 1641 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TFIP11Q9UBB9 ABCD1P2-201ENST00000429313 1601 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TFIP11Q9UBB9 EFHC2-202ENST00000420999 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TFIP11Q9UBB9 FHOD3-201ENST00000257209 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TFIP11Q9UBB9 TEX26-AS1-205ENST00000585870 2053 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TFIP11Q9UBB9 MAP7-201ENST00000354570 4152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TFIP11Q9UBB9 C19orf33-201ENST00000301246 467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TFIP11Q9UBB9 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TFIP11Q9UBB9 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TFIP11Q9UBB9 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TFIP11Q9UBB9 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TFIP11Q9UBB9 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TFIP11Q9UBB9 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TFIP11Q9UBB9 MRAS-205ENST00000474559 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TFIP11Q9UBB9 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TFIP11Q9UBB9 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TFIP11Q9UBB9 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TFIP11Q9UBB9 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TFIP11Q9UBB9 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TFIP11Q9UBB9 AC022182.2-201ENST00000525556 859 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TFIP11Q9UBB9 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TFIP11Q9UBB9 MAX-218ENST00000557746 571 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TFIP11Q9UBB9 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TFIP11Q9UBB9 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TFIP11Q9UBB9 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TFIP11Q9UBB9 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TFIP11Q9UBB9 AC011479.1-202ENST00000591889 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TFIP11Q9UBB9 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TFIP11Q9UBB9 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TFIP11Q9UBB9 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TFIP11Q9UBB9 CDC42SE2-202ENST00000395246 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TFIP11Q9UBB9 TMEM40-205ENST00000435575 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TFIP11Q9UBB9 FUT3-207ENST00000589620 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TFIP11Q9UBB9 THSD4-201ENST00000261862 3133 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TFIP11Q9UBB9 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TFIP11Q9UBB9 MICAL1-202ENST00000358807 3645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TFIP11Q9UBB9 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TFIP11Q9UBB9 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TFIP11Q9UBB9 AMER1-202ENST00000374869 3688 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TFIP11Q9UBB9 CBLB-204ENST00000405772 3237 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TFIP11Q9UBB9 PCDHGA6-202ENST00000610583 5650 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TFIP11Q9UBB9 ERAL1-201ENST00000254928 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TFIP11Q9UBB9 PHF2-203ENST00000610682 2921 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TFIP11Q9UBB9 PI4KB-203ENST00000368874 3934 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TFIP11Q9UBB9 AKR1C2-202ENST00000421196 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TFIP11Q9UBB9 CALB1-201ENST00000265431 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TFIP11Q9UBB9 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TFIP11Q9UBB9 LRRC41-208ENST00000617760 2158 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TFIP11Q9UBB9 ALOX15B-202ENST00000380183 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TFIP11Q9UBB9 AC092171.2-201ENST00000444210 3251 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms