Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E5

CHPF2, Chondroitin sulfate glucuronyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHPF2Q9P2E5 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHPF2Q9P2E5 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHPF2Q9P2E5 AGAP10P-201ENST00000454844 2418 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CHPF2Q9P2E5 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHPF2Q9P2E5 PGD-201ENST00000270776 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHPF2Q9P2E5 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHPF2Q9P2E5 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHPF2Q9P2E5 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHPF2Q9P2E5 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHPF2Q9P2E5 SNRPC-201ENST00000244520 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHPF2Q9P2E5 CCDC167-201ENST00000373408 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHPF2Q9P2E5 KRTAP10-5-201ENST00000400372 1150 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHPF2Q9P2E5 STK16-203ENST00000409516 895 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHPF2Q9P2E5 AL391839.2-201ENST00000412085 383 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHPF2Q9P2E5 LINC01868-201ENST00000414965 562 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHPF2Q9P2E5 AC018814.1-201ENST00000418972 357 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHPF2Q9P2E5 AC092265.1-201ENST00000422638 498 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHPF2Q9P2E5 RPL13AP19-201ENST00000434320 584 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CHPF2Q9P2E5 LINC00028-201ENST00000435497 587 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHPF2Q9P2E5 AC006529.1-201ENST00000459978 637 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CHPF2Q9P2E5 COQ10BP2-201ENST00000513804 724 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CHPF2Q9P2E5 EIF3K-202ENST00000538434 966 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHPF2Q9P2E5 BATF-202ENST00000555504 361 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHPF2Q9P2E5 UPF3AP2-202ENST00000578315 730 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHPF2Q9P2E5 AC025048.2-201ENST00000590744 786 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHPF2Q9P2E5 MIA-206ENST00000597784 455 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHPF2Q9P2E5 AC138466.5-201ENST00000624002 808 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CHPF2Q9P2E5 AC021305.1-201ENST00000520656 1514 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CHPF2Q9P2E5 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHPF2Q9P2E5 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHPF2Q9P2E5 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHPF2Q9P2E5 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CHPF2Q9P2E5 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHPF2Q9P2E5 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CHPF2Q9P2E5 DSCAM-AS1-202ENST00000427451 1640 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHPF2Q9P2E5 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHPF2Q9P2E5 SEMA7A-202ENST00000542748 3228 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHPF2Q9P2E5 CRISP2-201ENST00000339139 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHPF2Q9P2E5 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHPF2Q9P2E5 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHPF2Q9P2E5 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHPF2Q9P2E5 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHPF2Q9P2E5 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHPF2Q9P2E5 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHPF2Q9P2E5 TUBB4AP1-201ENST00000450755 1325 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CHPF2Q9P2E5 ENDOV-207ENST00000518907 2418 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHPF2Q9P2E5 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHPF2Q9P2E5 LUC7L2-208ENST00000541170 1525 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHPF2Q9P2E5 CDC42SE2-202ENST00000395246 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHPF2Q9P2E5 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHPF2Q9P2E5 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHPF2Q9P2E5 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHPF2Q9P2E5 CPA5-206ENST00000474905 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHPF2Q9P2E5 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHPF2Q9P2E5 PGAM2-201ENST00000297283 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHPF2Q9P2E5 TRBV7-3-201ENST00000390361 397 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHPF2Q9P2E5 OR2W2P-201ENST00000406313 909 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CHPF2Q9P2E5 ACTG1P19-201ENST00000418987 1116 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CHPF2Q9P2E5 IGF1-205ENST00000424202 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHPF2Q9P2E5 VEGFB-202ENST00000426086 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHPF2Q9P2E5 AC034228.2-201ENST00000432558 459 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHPF2Q9P2E5 PRKCZ-AS1-202ENST00000444529 622 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHPF2Q9P2E5 FAHD2CP-203ENST00000467292 965 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHPF2Q9P2E5 RN7SL23P-201ENST00000484055 275 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CHPF2Q9P2E5 LAMTOR4-209ENST00000488241 613 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHPF2Q9P2E5 AC026410.1-201ENST00000507366 1101 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CHPF2Q9P2E5 AC012073.1-201ENST00000606114 1108 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CHPF2Q9P2E5 AC127024.7-201ENST00000625101 200 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CHPF2Q9P2E5 AC027559.1-203ENST00000635726 517 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHPF2Q9P2E5 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHPF2Q9P2E5 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHPF2Q9P2E5 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHPF2Q9P2E5 ZMYND15-206ENST00000592813 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHPF2Q9P2E5 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHPF2Q9P2E5 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHPF2Q9P2E5 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHPF2Q9P2E5 SNAPC2-206ENST00000597584 1413 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHPF2Q9P2E5 IL1RN-201ENST00000259206 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHPF2Q9P2E5 FDFT1-214ENST00000528812 2013 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHPF2Q9P2E5 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHPF2Q9P2E5 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHPF2Q9P2E5 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHPF2Q9P2E5 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHPF2Q9P2E5 NME7-203ENST00000472647 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHPF2Q9P2E5 ASGR1-209ENST00000619926 1384 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHPF2Q9P2E5 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHPF2Q9P2E5 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHPF2Q9P2E5 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHPF2Q9P2E5 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHPF2Q9P2E5 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHPF2Q9P2E5 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHPF2Q9P2E5 LAMA1-209ENST00000638611 1310 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHPF2Q9P2E5 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHPF2Q9P2E5 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHPF2Q9P2E5 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHPF2Q9P2E5 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHPF2Q9P2E5 DERL3-202ENST00000318109 860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHPF2Q9P2E5 APOA1-203ENST00000375320 940 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHPF2Q9P2E5 ZMIZ1-AS1-202ENST00000440151 814 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHPF2Q9P2E5 AC093300.1-201ENST00000510368 1201 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms