Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW4

MAP1LC3C, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3C, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3CQ9BXW4 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 ASNA1-205ENST00000611688 1214 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 NUSAP1-208ENST00000559596 1629 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 QRICH1-204ENST00000424300 3009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 PLOD2-201ENST00000282903 3732 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 ZFAT-202ENST00000429442 4421 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 TNS2-204ENST00000546602 4429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 SPACA6P-AS-201ENST00000602324 3962 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 EPS15L1-201ENST00000248070 2924 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 CYP24A1-203ENST00000395955 2227 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 SMG6-203ENST00000536871 1865 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 LIMS1-205ENST00000410093 1526 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM160B2-201ENST00000289921 4245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 CALM1-201ENST00000356978 4242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 ZMYND11-203ENST00000381591 4229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 MGAT4EP-201ENST00000330493 2810 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 LAMA5-201ENST00000252999 11426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC01623-201ENST00000440244 2458 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 KCNH1-202ENST00000367007 3445 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 CAMKK2-204ENST00000392473 2967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 SNX19-213ENST00000534726 1656 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 MYT1-203ENST00000536311 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 LAMB3-201ENST00000356082 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 ASPH-203ENST00000379454 5268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 FREM3-201ENST00000329798 6729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 DSN1-204ENST00000426836 2441 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 PLEC-201ENST00000322810 15249 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 SNRNP48-201ENST00000342415 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 SEPT10-202ENST00000397712 3071 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 CARMN-210ENST00000602964 8398 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM74B-201ENST00000381894 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 AGPAT1-203ENST00000375107 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 AL359510.2-201ENST00000624958 2249 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF148-206ENST00000485866 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 ORMDL2-201ENST00000243045 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 CAMSAP2-202ENST00000358823 7352 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC00656-201ENST00000443744 1896 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 CTNS-201ENST00000046640 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 PTGR2-205ENST00000555661 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 DCAF5-209ENST00000557386 2883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 AC106820.4-201ENST00000561847 5616 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 LPP-AS2-201ENST00000605573 2852 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 NEK3-205ENST00000610828 2396 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 CYB561D1-206ENST00000496961 3424 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 SHPRH-201ENST00000275233 6649 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 RGS16-201ENST00000367558 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 AP3S2-201ENST00000336418 5891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM200B-223ENST00000622362 4377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 PCDHA10-202ENST00000506939 3788 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 PKD1L2-210ENST00000533478 5669 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 ATG16L1-202ENST00000373525 2767 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC46A3-201ENST00000266943 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 WDR27-203ENST00000448612 3178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM156B-201ENST00000416841 2537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 ABCB9-211ENST00000540285 3330 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 OSBP2-203ENST00000403222 3728 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 SPATA2-201ENST00000289431 4022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.6 ms